71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6283 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  48.37 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  42.99 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  40.61 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  40.18 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  43.58 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  40.85 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  40.28 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  41.86 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  37.8 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  38.25 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  42.23 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  33.64 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  38.34 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  33.2 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  35.14 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  41.1 
 
 		 164 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  42.14 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  37.89 
 
 		 169 aa  111  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  40.94 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  40.15 
 
 		 187 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  32.89 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  41.01 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  38.41 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  38.41 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  31.21 
 
 		 162 aa  91.7  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  30.07 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0978  cyclase/dehydrase  31.37 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3397  Polyketide cyclase/dehydrase  28.11 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  30.61 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  29.58 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 		 159 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  34.33 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  26.9 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  29.29 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  30.6 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  30.08 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  29.08 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  31.34 
 
 		 152 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  31.58 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  29.69 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  29.8 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  29.32 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  26.62 
 
 		 409 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  26.47 
 
 		 149 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  30.94 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  30.94 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  28.26 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  27.46 
 
 		 416 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  24.46 
 
 		 394 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 		 143 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  28 
 
 		 148 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  27.41 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  27.82 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  28.83 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  27.69 
 
 		 146 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  25 
 
 		 150 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>