61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6854 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  100 
 
 
394 aa  773    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  62.42 
 
 
416 aa  358  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  54.09 
 
 
336 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  54.09 
 
 
335 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  54.09 
 
 
335 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2352  cyclase/dehydrase  40.96 
 
 
418 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.196534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  40.19 
 
 
330 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  35.76 
 
 
203 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  37.82 
 
 
162 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  38.71 
 
 
170 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  40.67 
 
 
159 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  36.67 
 
 
153 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  36.6 
 
 
232 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  36.31 
 
 
152 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  39.33 
 
 
159 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  36.09 
 
 
287 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  39.04 
 
 
156 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  33.54 
 
 
328 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  32.68 
 
 
155 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  37.09 
 
 
153 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  38.1 
 
 
216 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  36.84 
 
 
160 aa  99.8  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  36.09 
 
 
158 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  33.54 
 
 
300 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  31.65 
 
 
210 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  33.33 
 
 
156 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 
155 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  32.68 
 
 
205 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  35.37 
 
 
181 aa  89.7  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  32.67 
 
 
272 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  34.85 
 
 
143 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  31.34 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  30.38 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  38.38 
 
 
158 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  32.33 
 
 
225 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
244 aa  60.1  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  31.31 
 
 
197 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  25.56 
 
 
145 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  35.34 
 
 
212 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  35.34 
 
 
212 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  32.79 
 
 
214 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  27.52 
 
 
242 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14140  polyketide cyclase / dehydrase family protein  30 
 
 
164 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.850996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  30.17 
 
 
284 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  26.17 
 
 
243 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  30.36 
 
 
232 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  24.26 
 
 
240 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  26.19 
 
 
238 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  27.34 
 
 
187 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  26.95 
 
 
241 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  26.63 
 
 
231 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  24.29 
 
 
217 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
2507 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  26.61 
 
 
303 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 
256 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
198 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
244 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  28.57 
 
 
1197 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  30.48 
 
 
219 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>