36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3371 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  100 
 
 
409 aa  798    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  32.68 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5516  transport-associated protein  40.52 
 
 
159 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.428699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6562  transport-associated  45.69 
 
 
160 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  27.67 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6276  transport-associated  44.83 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0105604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4475  hypothetical protein  34.78 
 
 
160 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 
244 aa  67  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  26.11 
 
 
197 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6332  hypothetical protein  36.03 
 
 
164 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.24237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3317  transport-associated  38.06 
 
 
160 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3231  transport-associated  38.06 
 
 
160 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.324384  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  28 
 
 
225 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6151  transport-associated  40.52 
 
 
159 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379338  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6544  transport-associated  39.66 
 
 
136 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483761  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  27.94 
 
 
164 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1287  transport-associated  38.79 
 
 
136 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.740475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  25.13 
 
 
240 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  30.67 
 
 
219 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  25.71 
 
 
232 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  30.71 
 
 
269 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  26.89 
 
 
256 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5032  transport-associated  40.85 
 
 
156 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal  0.551678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  23.81 
 
 
243 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2346  Polyketide cyclase/dehydrase  30.19 
 
 
158 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222304  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  24.12 
 
 
241 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  25.17 
 
 
169 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  23.88 
 
 
242 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  25 
 
 
187 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  26.71 
 
 
203 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  28.03 
 
 
149 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3123  transport-associated protein  36.25 
 
 
160 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.355874  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  31.91 
 
 
146 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  20.1 
 
 
238 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  24.83 
 
 
156 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>