87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0577 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  100 
 
 
241 aa  500  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  72.69 
 
 
232 aa  314  9e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  68.06 
 
 
238 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  70.32 
 
 
164 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  60.12 
 
 
169 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  46.67 
 
 
256 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  54.27 
 
 
198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  50.84 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  39.66 
 
 
284 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  51.9 
 
 
244 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  40.91 
 
 
242 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  41.67 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  43.16 
 
 
243 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  35.54 
 
 
303 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 
219 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  48.65 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  45.81 
 
 
212 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  45.16 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  33.64 
 
 
240 aa  131  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3397  Polyketide cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
245 aa  131  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  40.49 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  33.63 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  28.63 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0978  cyclase/dehydrase  35.17 
 
 
151 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  35.71 
 
 
162 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 
162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  29.26 
 
 
237 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  34.69 
 
 
164 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 
197 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  38.51 
 
 
272 aa  92.4  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  38.13 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  36.81 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  37.14 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  30.94 
 
 
192 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  37.14 
 
 
159 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  36.24 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  33.79 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  36.11 
 
 
162 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  35.71 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  33.81 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  33.57 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  32.39 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  30.99 
 
 
203 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  32.26 
 
 
216 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  29.79 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  34.53 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6247  hypothetical protein  31.5 
 
 
131 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.69241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  33.77 
 
 
145 aa  62  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  32.21 
 
 
147 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  29.66 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  28.86 
 
 
149 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  29.5 
 
 
155 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  28.78 
 
 
156 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  29.58 
 
 
158 aa  58.5  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  30.14 
 
 
151 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  31.94 
 
 
149 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  31.75 
 
 
153 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  31.94 
 
 
149 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  30.56 
 
 
145 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  30.82 
 
 
148 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  30.53 
 
 
153 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  30.22 
 
 
145 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  26.9 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  27.64 
 
 
330 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  24.49 
 
 
156 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 
151 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  27.15 
 
 
150 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  28.18 
 
 
394 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14140  polyketide cyclase / dehydrase family protein  26.85 
 
 
164 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.850996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2352  cyclase/dehydrase  29.93 
 
 
418 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.196534 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  24.46 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  24.14 
 
 
152 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2346  Polyketide cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
158 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222304  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  23.12 
 
 
409 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  26.36 
 
 
416 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  23.18 
 
 
144 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  23.18 
 
 
144 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  23.18 
 
 
144 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  27.34 
 
 
143 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>