93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5344 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  52.94 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  49.32 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  48.65 
 
 		 241 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  47.27 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  48.63 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  46.98 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  47.27 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  46.67 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  43.79 
 
 		 244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  43.17 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  47.18 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  42.41 
 
 		 169 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  41.06 
 
 		 269 aa  124  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  38.51 
 
 		 243 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  41.01 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  41.55 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  39.16 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  37.84 
 
 		 242 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  41.43 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  39.74 
 
 		 284 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0978  cyclase/dehydrase  36.62 
 
 		 151 aa  108  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  40.15 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  35.03 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  37.5 
 
 		 223 aa  98.2  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 237 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  34.29 
 
 		 239 aa  90.9  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3397  Polyketide cyclase/dehydrase  35.76 
 
 		 245 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  35.29 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6247  hypothetical protein  34.68 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  33.58 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  31.16 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  29.53 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 		 337 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  31.69 
 
 		 300 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  35.29 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  27.7 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 328 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  26.75 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  28.22 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  28.99 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  34.78 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  28.3 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  27.54 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  26.81 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  32 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  33.81 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  33.81 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  32.88 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  32.84 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  28.68 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  30.43 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  26.81 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  28.37 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  26.35 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  27.74 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  26.09 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  32.12 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  28.77 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  28.48 
 
 		 330 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  26.21 
 
 		 416 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  27.82 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  27.34 
 
 		 394 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  25.9 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  23.02 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  24.68 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  27.39 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  24.11 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  23.91 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  22.46 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  26.12 
 
 		 335 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  23.91 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  26.12 
 
 		 336 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  26.54 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  24.5 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  26.12 
 
 		 335 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  24.64 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 409 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 217 aa  44.7  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0753  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  27.94 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0767  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  25.36 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1738  cyclase/dehydrase  25.88 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.265595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0747  hypothetical protein  27.95 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11940  hypothetical protein  34.15 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>