76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1093 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  56.29 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  57.24 
 
 		 152 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  50.56 
 
 		 328 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  54.73 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  56.08 
 
 		 155 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  45.71 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  54.42 
 
 		 272 aa  168  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  51.61 
 
 		 162 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  53.42 
 
 		 155 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  49.36 
 
 		 156 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  51.37 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  50 
 
 		 153 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  49.66 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  50 
 
 		 287 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  41.38 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  44.87 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  47.97 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  47.97 
 
 		 153 aa  147  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  43.95 
 
 		 337 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  46.31 
 
 		 300 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  45.58 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  44.83 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  44.83 
 
 		 170 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  44.14 
 
 		 159 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  41.56 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  37.18 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 143 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  36.03 
 
 		 145 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14140  polyketide cyclase / dehydrase family protein  34.55 
 
 		 164 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.850996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  33.55 
 
 		 330 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  32.48 
 
 		 416 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  33.83 
 
 		 335 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  33.83 
 
 		 335 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  33.83 
 
 		 336 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2352  cyclase/dehydrase  29.75 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.196534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  31.51 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  35 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  33.53 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  29.08 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  30.38 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  29.22 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  32.65 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  26.03 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  28.08 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  29.25 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  26.21 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  28.86 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  25.95 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  26.71 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  24.83 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  26.43 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  26.62 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  28.79 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  24.55 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  21.01 
 
 		 157 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.561031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  23.45 
 
 		 239 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  24.82 
 
 		 164 aa  48.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  31.71 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  24.5 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  26.17 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  22.14 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  22.52 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  26.85 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  26.35 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  20.71 
 
 		 156 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  24.62 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  23.19 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  20 
 
 		 156 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  20 
 
 		 156 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>