18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2547 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2547  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5310  hypothetical protein  34.84 
 
 
162 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  hitchhiker  0.00163358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5723  hypothetical protein  34.87 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2530  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0293088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6223  hypothetical protein  33.97 
 
 
162 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0731  hypothetical protein  32.64 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0748  hypothetical protein  32.64 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.042872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3947  hypothetical protein  31.25 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0812209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0829  hypothetical protein  31.36 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000209543  hitchhiker  0.0000111881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  26.97 
 
 
547 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0376  hypothetical protein  31.95 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0858  hypothetical protein  31.95 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1450  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00351642  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34770  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  58.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1716  hypothetical protein  30.61 
 
 
157 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1229  hypothetical protein  27.89 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1252  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000133913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2074  hypothetical protein  25.32 
 
 
339 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>