More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3575 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
344 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  34.73 
 
 
351 aa  219  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  34.73 
 
 
343 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  39.4 
 
 
345 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  32.14 
 
 
341 aa  196  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  34.62 
 
 
339 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  35 
 
 
349 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  34.08 
 
 
349 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  33.64 
 
 
368 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  35.78 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  35.74 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  32.3 
 
 
379 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  32.19 
 
 
393 aa  170  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  31.72 
 
 
355 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  33.33 
 
 
390 aa  169  8e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  31.39 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  33.44 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  31.39 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  29.49 
 
 
396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  30.91 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  30.91 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  30.91 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  30.91 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  30.91 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  31.7 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  34.78 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  31.3 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  34.78 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  31.67 
 
 
372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  32.84 
 
 
357 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  31.27 
 
 
353 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  32.67 
 
 
368 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  32.38 
 
 
363 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  33.03 
 
 
379 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  31.89 
 
 
374 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  32.7 
 
 
374 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  32.93 
 
 
354 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  30.96 
 
 
415 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  31.25 
 
 
373 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  31.38 
 
 
373 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  31.43 
 
 
357 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  31.25 
 
 
348 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  31.25 
 
 
361 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  34.57 
 
 
382 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  31.25 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  31.25 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  31.25 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  31.25 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  30.63 
 
 
361 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  30.4 
 
 
373 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  30.09 
 
 
376 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  30.63 
 
 
361 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  31.46 
 
 
373 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  32.58 
 
 
388 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  31.06 
 
 
367 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  31.37 
 
 
368 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  34.47 
 
 
370 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  30 
 
 
361 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.9 
 
 
405 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  31.15 
 
 
376 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  31.15 
 
 
376 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  31.15 
 
 
376 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  29.79 
 
 
373 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  31.15 
 
 
376 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  30 
 
 
361 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  31.15 
 
 
373 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 
354 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  34.43 
 
 
382 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  32.12 
 
 
363 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  32.37 
 
 
361 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  32.1 
 
 
357 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  32.81 
 
 
357 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  31.36 
 
 
357 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  31.07 
 
 
356 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  32.48 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  31.66 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  31.15 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  31.36 
 
 
354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  32.48 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  30.6 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  29.65 
 
 
366 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  33.99 
 
 
358 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  33.99 
 
 
375 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  29.94 
 
 
352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  31.37 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  34.63 
 
 
353 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  33.24 
 
 
418 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  32.47 
 
 
398 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  33.75 
 
 
382 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  28.88 
 
 
392 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  30.08 
 
 
435 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.38 
 
 
402 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.38 
 
 
402 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  30.08 
 
 
424 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  33.86 
 
 
375 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  31.7 
 
 
357 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  29.34 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  34.17 
 
 
434 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  30.42 
 
 
365 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  29.81 
 
 
366 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>