More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2111 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  707    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  50.57 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  50 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  55.29 
 
 		 360 aa  318  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  50.28 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  47.18 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  50.14 
 
 		 357 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  51.85 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  50.14 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  50.29 
 
 		 354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  57.49 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  42.49 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  48.15 
 
 		 389 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  46.05 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  44.24 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  44.24 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  46.74 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  42.72 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  47.24 
 
 		 364 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  40.36 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  41.19 
 
 		 665 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  37.28 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  41.18 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  41.12 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  37.75 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  37.54 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  36.71 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  40.88 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  38.55 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  35.65 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  40.06 
 
 		 366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  40.37 
 
 		 383 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  39.23 
 
 		 361 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  37.61 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  38.84 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  40.59 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  47.25 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  40.06 
 
 		 356 aa  205  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  38.86 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  38.7 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  37.69 
 
 		 379 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  40.61 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  37.75 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  41.92 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  37.46 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  36.86 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  35.98 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  37.18 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  35.88 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  44.24 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  36.83 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  38.7 
 
 		 434 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  36.04 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  37.43 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  37.43 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  38.05 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  33.15 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  37.65 
 
 		 382 aa  175  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  34 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  38.33 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  33.03 
 
 		 329 aa  173  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  35.65 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  32.23 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  34.83 
 
 		 452 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  36.67 
 
 		 353 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  37.17 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  32.93 
 
 		 370 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  33.23 
 
 		 368 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  31.37 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  32.31 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  30.49 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  38.21 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  29.2 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.25 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  28.74 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.39 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  30.26 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.13 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  29.33 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  30.26 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  32.66 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  31.11 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  26.06 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.55 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.44 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.44 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  26.57 
 
 		 402 aa  129  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  30.25 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.41 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  29.25 
 
 		 348 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.7 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.1 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.1 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.1 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.1 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.67 
 
 		 371 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>