More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0858 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 402 aa  787    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  68.09 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.45 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  26.9 
 
 		 356 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.57 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  28.77 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  30.09 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  29.61 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  27.17 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  27.3 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  28.25 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  28.05 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  27.42 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  25.53 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  30.33 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  27.3 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  26.78 
 
 		 360 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.54 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27.54 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  25.53 
 
 		 357 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.25 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  27.81 
 
 		 665 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  26.91 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.67 
 
 		 329 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  25.45 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  27.47 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  28.66 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  27.11 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  28.19 
 
 		 418 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  26.4 
 
 		 374 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  27.25 
 
 		 357 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  26.19 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  29.87 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  27.7 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  24.78 
 
 		 368 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.26 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  27.32 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  27.32 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  27.04 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  23.56 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.3 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  26.91 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25.33 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  24.18 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.17 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  27.95 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.43 
 
 		 402 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.43 
 
 		 402 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.63 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  23.17 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.44 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  26.42 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  25.29 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  26.74 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 		 358 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  26.8 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  28.16 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.6 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.91 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.09 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  25.23 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.67 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.92 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  25.66 
 
 		 382 aa  96.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  25.36 
 
 		 357 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  27.14 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  25 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.65 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  24.47 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  25.33 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.05 
 
 		 355 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  27.3 
 
 		 355 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  27.3 
 
 		 355 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  27.3 
 
 		 355 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  27.3 
 
 		 355 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  27.3 
 
 		 355 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  24.07 
 
 		 359 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  26.51 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.35 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  26.42 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  26.42 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  26.42 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  26.42 
 
 		 355 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  29.44 
 
 		 372 aa  93.2  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  26.42 
 
 		 355 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  25.32 
 
 		 360 aa  93.2  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.81 
 
 		 343 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  27.71 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.96 
 
 		 355 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  26.03 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  22.38 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.24 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  25.53 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>