More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3565 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  680    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  61.35 
 
 		 353 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  62.92 
 
 		 353 aa  341  9e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  49.15 
 
 		 356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  49.15 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  49.57 
 
 		 356 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  50.71 
 
 		 356 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  48.01 
 
 		 358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  48.43 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  49.43 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  46.97 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.7 
 
 		 665 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  38.55 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  42.09 
 
 		 357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  38.86 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  41.26 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  38.55 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  40.5 
 
 		 357 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  38.68 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  38.29 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  41.21 
 
 		 357 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  40.92 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  39.76 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  40.92 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  40.92 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  39.76 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  42.42 
 
 		 360 aa  195  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  36.6 
 
 		 379 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  37.39 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  34.83 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  43.77 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  33.24 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  34.62 
 
 		 368 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  37.61 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  42.22 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  34.22 
 
 		 367 aa  169  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  39.09 
 
 		 364 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  34.55 
 
 		 415 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  34.44 
 
 		 452 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  33.93 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  39.12 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  34.38 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  34.73 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  38.82 
 
 		 385 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  34.4 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  34.4 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  35.52 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  29.69 
 
 		 374 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  34.46 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  30.4 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  35.57 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  35.22 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  32.69 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  34.46 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  33.24 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 		 374 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  35.55 
 
 		 370 aa  149  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  35.55 
 
 		 370 aa  149  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  26.11 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  31.18 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  34.52 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  35.79 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  34.18 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  35.98 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  34.25 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  30 
 
 		 373 aa  141  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  33.05 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  32.28 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  32.06 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  34.97 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  35.13 
 
 		 375 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  34.47 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  34.09 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  28.49 
 
 		 396 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 		 402 aa  129  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  29.03 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  29.03 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  29.03 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  29.03 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  29.03 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.15 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  28.39 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  28.3 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  28.39 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.98 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.82 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  33.93 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.44 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0071  protein of unknown function UPF0118  23.12 
 
 		 435 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  28.71 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  28.39 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1689  protein of unknown function UPF0118  31.34 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.5 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.55 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.57 
 
 		 393 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 		 353 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  28.27 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  28.09 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>