More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2774 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  68.26 
 
 
356 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  68.26 
 
 
356 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  68.82 
 
 
356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  51.83 
 
 
358 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  53.24 
 
 
383 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  53.24 
 
 
358 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  50.71 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  49.54 
 
 
353 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  45.92 
 
 
329 aa  278  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  48.82 
 
 
368 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  48.86 
 
 
353 aa  275  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  43.6 
 
 
665 aa  252  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  44.41 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  41.12 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  39.6 
 
 
357 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  39.54 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  39.24 
 
 
357 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  38.95 
 
 
357 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  38.95 
 
 
354 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  40.29 
 
 
360 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  38 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  37.64 
 
 
388 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  40 
 
 
357 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  35.8 
 
 
379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  36.59 
 
 
363 aa  195  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  34.97 
 
 
378 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 
347 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  34.39 
 
 
415 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  37.5 
 
 
347 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  32.96 
 
 
404 aa  186  8e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  34.85 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  34.85 
 
 
367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  36.73 
 
 
374 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  33.43 
 
 
366 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  40.41 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  41.73 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  36.47 
 
 
361 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  33.53 
 
 
382 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  35.87 
 
 
358 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  35.87 
 
 
375 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  36.54 
 
 
380 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  33.24 
 
 
382 aa  175  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  34.47 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  34.43 
 
 
364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  32.87 
 
 
374 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  33.71 
 
 
374 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  37.95 
 
 
364 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  32.2 
 
 
382 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  34.86 
 
 
357 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  33.23 
 
 
418 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  33.24 
 
 
368 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  32.66 
 
 
398 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  34.63 
 
 
547 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  26.43 
 
 
354 aa  160  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  33.93 
 
 
370 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  33.91 
 
 
434 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  36.26 
 
 
389 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  34.44 
 
 
370 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  34.44 
 
 
370 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  27.11 
 
 
379 aa  150  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  31.15 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  30.84 
 
 
365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  35.9 
 
 
369 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  31.42 
 
 
452 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  36.82 
 
 
382 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  33.24 
 
 
370 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  32.19 
 
 
344 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.94 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  32.66 
 
 
385 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  33.52 
 
 
382 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  32.93 
 
 
375 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  32.66 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.9 
 
 
343 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 
351 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.97 
 
 
402 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.97 
 
 
402 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  26.72 
 
 
373 aa  125  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31.56 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  25.85 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.69 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.25 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.65 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.33 
 
 
355 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.33 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.31 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  28.27 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  27.09 
 
 
384 aa  112  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  28.21 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.18 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.33 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  25.3 
 
 
356 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  25.6 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  29.26 
 
 
365 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.67 
 
 
350 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>