More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1623 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  100 
 
 		 367 aa  737    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  98.09 
 
 		 368 aa  727    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  66.94 
 
 		 366 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  40.06 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  39.2 
 
 		 357 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  40.78 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  38.48 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  41.31 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  41.43 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  41.31 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  41.99 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  36.71 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  37.31 
 
 		 360 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  35.29 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  38.02 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  41 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  36.65 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  36.65 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  37.14 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  32.78 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  33.24 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  33.73 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  33.83 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  32.32 
 
 		 361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  38.08 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  32.03 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  33.13 
 
 		 434 aa  179  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  37.81 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  34.42 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  33.94 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  30.89 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  32.42 
 
 		 398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  33.94 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  34.4 
 
 		 356 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  31.65 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  31.65 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  33.71 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  33.9 
 
 		 375 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  34.81 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  34.15 
 
 		 356 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  33.71 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  32.87 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  31.01 
 
 		 379 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  33.8 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  32.73 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  32.66 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  32.02 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  32.95 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  32.16 
 
 		 665 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  34.64 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  31.59 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  34.21 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  34.21 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  31.06 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  33.62 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  32.6 
 
 		 404 aa  152  7e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  33.74 
 
 		 353 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  30.09 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  27.08 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  32.04 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  35.64 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  31.45 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  30.21 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.94 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  30.68 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  29.33 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  26.5 
 
 		 452 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  31.61 
 
 		 547 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  28.69 
 
 		 373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  29.59 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  32.73 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 436 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.99 
 
 		 370 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  28.92 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.08 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  25.87 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.25 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  26.93 
 
 		 344 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  26.44 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.03 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.01 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.01 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.01 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.01 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.01 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.17 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.93 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.06 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.06 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 353 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.4 
 
 		 345 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  25.45 
 
 		 357 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  27.5 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  28.31 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  26.82 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  27.01 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>