More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2164 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  713    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  49 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  47.27 
 
 		 379 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  44.88 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  45.92 
 
 		 379 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  45.68 
 
 		 374 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  49.72 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  49.72 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  45.92 
 
 		 415 aa  302  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  44.86 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  50 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  51.51 
 
 		 547 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  45.63 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  46.63 
 
 		 382 aa  285  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  44.44 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  46.36 
 
 		 382 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  44.94 
 
 		 404 aa  278  9e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  46.24 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  47.18 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  47.18 
 
 		 375 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  47.14 
 
 		 361 aa  272  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  46.32 
 
 		 398 aa  265  8e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  43.68 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  46.97 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  45.06 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  47.47 
 
 		 375 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  47.4 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  44.86 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  42.18 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  42.31 
 
 		 388 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  42.37 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  41.11 
 
 		 357 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  41.41 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  40.17 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  38.21 
 
 		 363 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  42.73 
 
 		 389 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  41.09 
 
 		 357 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  39.22 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  39.27 
 
 		 357 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  36.26 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  37.72 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  37.72 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  41.48 
 
 		 360 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  37.39 
 
 		 665 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  30.23 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  34.33 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  34.72 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  33.53 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  30.25 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  40.73 
 
 		 364 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  34.58 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  41.5 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  33.52 
 
 		 356 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  34.57 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  31.88 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  36.02 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  38.58 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  33.64 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  38.87 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  35.05 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  32.96 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  36.42 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  35.9 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  34.47 
 
 		 358 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  34.16 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.22 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  40 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  35.9 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  31.72 
 
 		 327 aa  156  6e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  41.46 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  30.13 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31.94 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  34.37 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.75 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.9 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  27.55 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  27.22 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  30.77 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  30.18 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.91 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.71 
 
 		 341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.91 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.62 
 
 		 405 aa  129  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.3 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.3 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.3 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.3 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.3 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  29.82 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.16 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.71 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.48 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.62 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.62 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.77 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  26.83 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 		 392 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  31.37 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>