More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02243 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02243  permease  100 
 
 		 388 aa  753    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  71.83 
 
 		 389 aa  508  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  70.13 
 
 		 385 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  70.13 
 
 		 385 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  47.18 
 
 		 363 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  48.3 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  48.15 
 
 		 357 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  49.28 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  50.45 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  46.15 
 
 		 357 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  47.59 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  47.31 
 
 		 357 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  47.59 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  45.2 
 
 		 347 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  45.2 
 
 		 347 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  49.26 
 
 		 364 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  40.75 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  50.43 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  50.87 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  40 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  39.54 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  38.48 
 
 		 367 aa  229  5e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  38.55 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  38.7 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  37.64 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  37.12 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  39.39 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  39.38 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  39.88 
 
 		 375 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  39.88 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  36.47 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  40.6 
 
 		 665 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  37.37 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  38.68 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  37.2 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  37.4 
 
 		 382 aa  203  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  36.84 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  35.93 
 
 		 404 aa  196  6e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  39.39 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  39.29 
 
 		 357 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  39.17 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  38.32 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  38.32 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  38.52 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  40.11 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  36.34 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  40 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  38.04 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  37.75 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  38.05 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  42.31 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  38.02 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  37.35 
 
 		 434 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  40.65 
 
 		 370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  39.54 
 
 		 358 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  36.18 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  38.18 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  38.11 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  37.32 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  42.43 
 
 		 547 aa  176  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  34.24 
 
 		 452 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  40.86 
 
 		 382 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  40.06 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  26.97 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  31.3 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  33.14 
 
 		 329 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  34.24 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  27.35 
 
 		 379 aa  156  4e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  33.43 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.39 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  32.96 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.03 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  28.27 
 
 		 355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  34.72 
 
 		 329 aa  146  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  29.28 
 
 		 373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  35.25 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  28.45 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.83 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.43 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.61 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.59 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.72 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.72 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  30.42 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.42 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  26.93 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.69 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.77 
 
 		 361 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.77 
 
 		 361 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.77 
 
 		 361 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.33 
 
 		 361 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 		 349 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>