More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0960 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
353 aa  700    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  71.1 
 
 
353 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  48.6 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  48.59 
 
 
355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  47.71 
 
 
355 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  47.71 
 
 
355 aa  318  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  47.71 
 
 
355 aa  318  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  47.71 
 
 
355 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  47.71 
 
 
355 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  47.35 
 
 
352 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  46.79 
 
 
355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  47.71 
 
 
355 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  47.4 
 
 
356 aa  299  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  35.22 
 
 
354 aa  218  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  32.91 
 
 
343 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  31.86 
 
 
361 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  30.99 
 
 
361 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  30.99 
 
 
361 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  30.99 
 
 
361 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  31.27 
 
 
373 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  31.27 
 
 
361 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  30.79 
 
 
348 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  32.27 
 
 
368 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.88 
 
 
351 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  31.18 
 
 
361 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  30.7 
 
 
361 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  30.7 
 
 
361 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  31.07 
 
 
348 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  32.3 
 
 
349 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  34.29 
 
 
344 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  28.36 
 
 
396 aa  168  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  34.11 
 
 
345 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  31.65 
 
 
349 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  29.17 
 
 
390 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  30.11 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  31.89 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  29.51 
 
 
373 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  29.37 
 
 
341 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  29.51 
 
 
373 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  28.65 
 
 
373 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.17 
 
 
402 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.17 
 
 
402 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  28.65 
 
 
376 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.84 
 
 
405 aa  157  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  28.37 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  28.37 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  28.37 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  28.37 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  28.37 
 
 
373 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  29.63 
 
 
373 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  31.44 
 
 
417 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  30.96 
 
 
357 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  31.82 
 
 
388 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  30.28 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  29.41 
 
 
379 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  31.79 
 
 
357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  29.91 
 
 
361 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  29.91 
 
 
361 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  33.44 
 
 
404 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 
374 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  28.44 
 
 
345 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  29.33 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  32.64 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  27.01 
 
 
392 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  30.3 
 
 
374 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  30.56 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  27.51 
 
 
375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  30.31 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  30.46 
 
 
415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.27 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  28.88 
 
 
364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  30.52 
 
 
368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  29.91 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  30.61 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 
438 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  29.82 
 
 
357 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  30.81 
 
 
452 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  29.28 
 
 
357 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  29.17 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  29.6 
 
 
357 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  25.9 
 
 
371 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  29.57 
 
 
379 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  30.86 
 
 
424 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  30.09 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  29.01 
 
 
357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  27.49 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  30.27 
 
 
665 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.27 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  28.88 
 
 
358 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  30.27 
 
 
374 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  28.7 
 
 
375 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.5 
 
 
348 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  30.03 
 
 
372 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  31.58 
 
 
356 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  31 
 
 
364 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  30.84 
 
 
356 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.41 
 
 
363 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  29.52 
 
 
339 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>