More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0657 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0657  permease  100 
 
 		 384 aa  760    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  41.82 
 
 		 382 aa  302  7.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  40.69 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  33.51 
 
 		 393 aa  242  7e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  32.46 
 
 		 405 aa  236  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  33.75 
 
 		 396 aa  233  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  32.19 
 
 		 361 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  32.98 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  32.97 
 
 		 376 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  32.71 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  32.79 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  32.7 
 
 		 373 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  32.45 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  32.7 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  32.7 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  32.7 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  32.43 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  29.8 
 
 		 361 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  29.8 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  29.8 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  29.8 
 
 		 361 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  29.8 
 
 		 361 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  29.8 
 
 		 361 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  29.8 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  29.8 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  29.68 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  29.68 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  33.06 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  28.74 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  34.51 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  31.22 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  32.49 
 
 		 361 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  32.49 
 
 		 361 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  31.41 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.23 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  28.53 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  30.66 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  32.93 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.56 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  30.85 
 
 		 382 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.65 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.36 
 
 		 379 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.48 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.45 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.49 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  27.78 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  27.02 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  27.92 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  30.33 
 
 		 368 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.9 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.9 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.9 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.9 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.9 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  28.92 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  28.92 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  25.46 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.46 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  27.58 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.37 
 
 		 351 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  25.99 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  32.18 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  27.87 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.62 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  27.36 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.89 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  27.36 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  25.86 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  27.45 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  29.58 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  28.48 
 
 		 350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  27.65 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  27.81 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  26.71 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.15 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  27.4 
 
 		 368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  27.42 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  27.06 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  28.38 
 
 		 353 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.25 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.41 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  27.19 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.4 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  24.92 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  24.92 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.3 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  30.15 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  27.65 
 
 		 365 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.55 
 
 		 349 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  27.25 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  25.89 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  26.47 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  27.6 
 
 		 357 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  27.3 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>