More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0555 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  758    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 
389 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.84 
 
 
365 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  27.17 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  25.57 
 
 
359 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  26.04 
 
 
359 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  24.8 
 
 
420 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  26.55 
 
 
663 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 
353 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 
354 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  25 
 
 
389 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  23.81 
 
 
390 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25 
 
 
361 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  24.05 
 
 
393 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  23.16 
 
 
668 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  23.16 
 
 
679 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  25.71 
 
 
644 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.96 
 
 
361 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.96 
 
 
361 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.05 
 
 
348 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.96 
 
 
361 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.32 
 
 
361 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.64 
 
 
373 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.32 
 
 
361 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.4 
 
 
361 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.64 
 
 
361 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.64 
 
 
348 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.62 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  24.84 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  25 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  21.47 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  25.39 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 
653 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  24.28 
 
 
434 aa  96.3  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.27 
 
 
387 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  24.67 
 
 
650 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.24 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  23.85 
 
 
675 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.89 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  24.93 
 
 
348 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  22.99 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  23.31 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  24.44 
 
 
349 aa  94.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  24.77 
 
 
406 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  24.77 
 
 
388 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  21.66 
 
 
405 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 
662 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  25.87 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  25.29 
 
 
438 aa  93.2  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  25.85 
 
 
650 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 
369 aa  93.2  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.36 
 
 
369 aa  93.2  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.01 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  25.55 
 
 
349 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  25.87 
 
 
349 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  27.47 
 
 
341 aa  92.8  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  25.87 
 
 
349 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.87 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.87 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  24.91 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.87 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.87 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.87 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  24.52 
 
 
652 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  24.24 
 
 
649 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.67 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  24.39 
 
 
652 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.37 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  24.85 
 
 
650 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  23.46 
 
 
385 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.08 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  25.07 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  26.6 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  23.38 
 
 
366 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  25.32 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.49 
 
 
405 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.08 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  22.68 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  24.29 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.58 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  23.76 
 
 
659 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  25.75 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.46 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.46 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.46 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  26.35 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.46 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.46 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.46 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.42 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  25 
 
 
647 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  27.49 
 
 
606 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  27.86 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  26.07 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  25 
 
 
349 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  25 
 
 
349 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  25 
 
 
349 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>