More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03323 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  100 
 
 		 349 aa  687    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 349 aa  687    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  687    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  99.71 
 
 		 349 aa  687    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  99.71 
 
 		 349 aa  685    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  99.71 
 
 		 349 aa  687    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  99.43 
 
 		 349 aa  684    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  687    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  100 
 
 		 349 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  90.26 
 
 		 349 aa  634    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  89.11 
 
 		 349 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  88.83 
 
 		 349 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  88.83 
 
 		 349 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  88.83 
 
 		 349 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  88.54 
 
 		 349 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  48.4 
 
 		 352 aa  322  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  48.4 
 
 		 352 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  48.4 
 
 		 352 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  52.23 
 
 		 350 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  46.9 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  46.9 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  46.9 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  46.9 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  46.61 
 
 		 344 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  46.61 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  46.02 
 
 		 344 aa  272  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  46.02 
 
 		 344 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  46.02 
 
 		 344 aa  271  9e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  46.02 
 
 		 344 aa  271  9e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  46.02 
 
 		 344 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  46.02 
 
 		 344 aa  271  9e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  46.02 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  42.39 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  45.72 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  45.72 
 
 		 344 aa  268  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  43.69 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  41.82 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  41.27 
 
 		 359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  40.53 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  41.47 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  40.06 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  41.23 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  41.18 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  41.18 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  40.06 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  42.9 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  39.64 
 
 		 369 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  39.35 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  39.35 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  39.35 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  40.72 
 
 		 372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  38.82 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  37.97 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  36.76 
 
 		 350 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  40.67 
 
 		 353 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  37.69 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  38.1 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  34.38 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  40.73 
 
 		 350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  34.4 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  38.24 
 
 		 360 aa  203  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  35.24 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  34.45 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  32.34 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  31.53 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  34.51 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 		 409 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  33.53 
 
 		 338 aa  150  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  29 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  28.44 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  32.08 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  27.44 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  29.01 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  30.15 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  27.08 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  27.68 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  28.08 
 
 		 438 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  29.05 
 
 		 663 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4918  protein of unknown function UPF0118  28.19 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  28.07 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  25.82 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  25.5 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  27.09 
 
 		 662 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  27.51 
 
 		 644 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 		 662 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  27.9 
 
 		 650 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  24.55 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1025  hypothetical protein  29.47 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.297957 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  24.55 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  25.5 
 
 		 675 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  25.28 
 
 		 679 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  25.28 
 
 		 668 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  33.53 
 
 		 362 aa  102  7e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1291  hypothetical protein  26.65 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0482108  normal  0.0196495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  25.58 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  26.92 
 
 		 660 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.97 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>