More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1704 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1280    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  54.01 
 
 		 647 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  51.04 
 
 		 650 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  50.24 
 
 		 650 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  47.05 
 
 		 650 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  44.12 
 
 		 668 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  44.12 
 
 		 679 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  44.77 
 
 		 675 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  44.24 
 
 		 677 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  44.37 
 
 		 659 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  47.44 
 
 		 651 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  47.27 
 
 		 651 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  45.04 
 
 		 680 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  44.26 
 
 		 679 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  41.18 
 
 		 680 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  44.83 
 
 		 660 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  44.83 
 
 		 660 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  44.22 
 
 		 645 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  39.78 
 
 		 660 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  44.8 
 
 		 700 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  41.41 
 
 		 653 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  39.2 
 
 		 662 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  40.65 
 
 		 652 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  40.46 
 
 		 606 aa  389  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  40.6 
 
 		 649 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  40.52 
 
 		 652 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  40.52 
 
 		 652 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  38.08 
 
 		 644 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  40.38 
 
 		 689 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  37.44 
 
 		 663 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  40.67 
 
 		 805 aa  365  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  40.58 
 
 		 647 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  35.35 
 
 		 662 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  40.5 
 
 		 657 aa  345  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  41.12 
 
 		 821 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  36.39 
 
 		 830 aa  310  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  36.08 
 
 		 824 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  36.67 
 
 		 801 aa  303  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  35.83 
 
 		 782 aa  302  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  37.47 
 
 		 879 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  27.51 
 
 		 385 aa  125  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  26.24 
 
 		 394 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25.92 
 
 		 420 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  26 
 
 		 349 aa  110  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  25.14 
 
 		 380 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  25.74 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  24.05 
 
 		 373 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  24.8 
 
 		 404 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  27.62 
 
 		 382 aa  107  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  28.65 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  26.79 
 
 		 393 aa  106  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  27.67 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  25.5 
 
 		 345 aa  104  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  24.79 
 
 		 359 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  25.97 
 
 		 368 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  25.91 
 
 		 358 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  26.4 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  25.33 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  22.49 
 
 		 336 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  25.33 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.13 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  28.41 
 
 		 359 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  26.8 
 
 		 360 aa  102  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  26.34 
 
 		 368 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  26.34 
 
 		 368 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.07 
 
 		 349 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 349 aa  100  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  100  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.07 
 
 		 349 aa  100  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  100  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  26.08 
 
 		 368 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  26.13 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  26.13 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  24.86 
 
 		 369 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  26.13 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  24.15 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  24.59 
 
 		 369 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  24.59 
 
 		 369 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  24.09 
 
 		 388 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  23.66 
 
 		 369 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  25.54 
 
 		 344 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  25.54 
 
 		 344 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  24.78 
 
 		 356 aa  98.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  25.37 
 
 		 394 aa  99  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  25.54 
 
 		 344 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  25.07 
 
 		 393 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  25.54 
 
 		 344 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  26.78 
 
 		 350 aa  98.2  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  25.6 
 
 		 349 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  25.27 
 
 		 344 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  25.28 
 
 		 354 aa  97.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  28.04 
 
 		 387 aa  96.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 		 358 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  26.78 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  24.65 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  25.93 
 
 		 374 aa  96.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  24.65 
 
 		 368 aa  95.1  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  25.28 
 
 		 345 aa  94.7  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>