More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3520 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  858    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  50.15 
 
 		 385 aa  352  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  45.89 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  47.02 
 
 		 406 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  47.02 
 
 		 388 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  39.07 
 
 		 353 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  33.92 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  32.75 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  36.2 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  33.92 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  31.55 
 
 		 386 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  35.21 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  35.17 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  32.1 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  34.38 
 
 		 374 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  29.71 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  32.15 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  33.75 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  31.66 
 
 		 338 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  34.4 
 
 		 368 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  33.82 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  31.23 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  31.34 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  31.83 
 
 		 366 aa  169  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  31.59 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  44.86 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  34.18 
 
 		 371 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  32.13 
 
 		 374 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  31.78 
 
 		 369 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0484  hypothetical protein  29.91 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  30.62 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  30.84 
 
 		 369 aa  153  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  31.82 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  29.48 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  31.16 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  31.01 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1260  hypothetical protein  28.74 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  30.14 
 
 		 606 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  29.64 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 		 359 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  27.73 
 
 		 679 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  27.73 
 
 		 668 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  27 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 		 675 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1324  hypothetical protein  29.97 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0575147  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  30.4 
 
 		 650 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  30.11 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 		 662 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 659 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  26.83 
 
 		 652 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  26.83 
 
 		 652 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  26.78 
 
 		 649 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  30.79 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01555  transport protein  29.17 
 
 		 296 aa  124  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  27.51 
 
 		 663 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  28.89 
 
 		 645 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0864  protein of unknown function UPF0118  26.82 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407336  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0992  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.537691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  29.65 
 
 		 399 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  29.79 
 
 		 824 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  28.28 
 
 		 830 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  28.3 
 
 		 644 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  28.18 
 
 		 680 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 		 652 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  27.3 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  29.13 
 
 		 689 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  27.03 
 
 		 805 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  27.7 
 
 		 647 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  27.15 
 
 		 651 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  27.15 
 
 		 651 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.22 
 
 		 365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  26 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  25.98 
 
 		 647 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  26.43 
 
 		 650 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  28.15 
 
 		 650 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  27.6 
 
 		 679 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  26.93 
 
 		 660 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  26.93 
 
 		 660 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  26.47 
 
 		 662 aa  107  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  26.89 
 
 		 821 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  25.3 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  26.57 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 653 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  26.28 
 
 		 353 aa  103  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  27.36 
 
 		 394 aa  103  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  29.55 
 
 		 436 aa  103  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  24.4 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  29.87 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  26.59 
 
 		 657 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  26.29 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  26.03 
 
 		 382 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  25.52 
 
 		 801 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  24.47 
 
 		 360 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  25.2 
 
 		 700 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  26.29 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  26.29 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  25.16 
 
 		 352 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  26.32 
 
 		 368 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>