More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0992 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0864  protein of unknown function UPF0118  94.33 
 
 		 388 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407336  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0992  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 396 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.537691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1260  hypothetical protein  54.6 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0336  hypothetical protein  51.16 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.115948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  31.03 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  28.02 
 
 		 374 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  29.97 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0484  hypothetical protein  24.84 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  29.41 
 
 		 387 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  27.49 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  27.37 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  27.37 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  30.55 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  27.09 
 
 		 368 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  27.69 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  26.76 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  23.99 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  23.68 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  25.24 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  25.24 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1324  hypothetical protein  28.82 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0575147  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  26.54 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  24.7 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  35 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  25.55 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  26.77 
 
 		 345 aa  96.3  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  23.88 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  27.68 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4175  hypothetical protein  32.11 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0228535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  26.39 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  24.44 
 
 		 369 aa  89.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 679 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  27.04 
 
 		 668 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  24.86 
 
 		 653 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01555  transport protein  27.52 
 
 		 296 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  24.61 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  24.72 
 
 		 677 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  24.84 
 
 		 394 aa  86.3  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  24.91 
 
 		 386 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 		 680 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  38.14 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  29.88 
 
 		 680 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  27.27 
 
 		 679 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  27.32 
 
 		 675 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  24.45 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  24.14 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  22.88 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  24.14 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  24.14 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  32 
 
 		 700 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  24.14 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  25.15 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  25.61 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  24.54 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  25.46 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  23.68 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  24.29 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  23.58 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  23.96 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  24.23 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  24.23 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  24.23 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  32.34 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  23.93 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  29.95 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  24.29 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  25.44 
 
 		 650 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  24.46 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  24.46 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  24.46 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  24.54 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  24.54 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  24.54 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  24.54 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  23.25 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  23.95 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  25.08 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  23.82 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  22.7 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  22.39 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  23.43 
 
 		 650 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  26.35 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  24.2 
 
 		 606 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  34.78 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  26.45 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  23.97 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  24.61 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  24.24 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4788  hypothetical protein  23.46 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  25.4 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  24.7 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  24.32 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  25.11 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  30.07 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  25.57 
 
 		 645 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  30.07 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>