More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5379 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  94.31 
 
 		 650 aa  1191    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 650 aa  1295    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  67.3 
 
 		 647 aa  838    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  50.16 
 
 		 650 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  50.31 
 
 		 677 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  47.29 
 
 		 680 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  43.94 
 
 		 650 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  43.32 
 
 		 675 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  42.44 
 
 		 668 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  42.44 
 
 		 679 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  43.03 
 
 		 680 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  44.25 
 
 		 651 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  44.93 
 
 		 679 aa  465  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  44.25 
 
 		 651 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  42.25 
 
 		 659 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  44.46 
 
 		 645 aa  459  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  43.55 
 
 		 660 aa  445  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  43.55 
 
 		 660 aa  445  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  40 
 
 		 662 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  41.32 
 
 		 660 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  42.78 
 
 		 653 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  42.05 
 
 		 649 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  41.11 
 
 		 700 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  41.4 
 
 		 652 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  41.4 
 
 		 652 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  42.42 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  39.68 
 
 		 652 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  39.83 
 
 		 606 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  42.71 
 
 		 647 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  41.19 
 
 		 689 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  40.61 
 
 		 663 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  37.93 
 
 		 662 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  37.96 
 
 		 644 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  35.75 
 
 		 805 aa  360  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  35.6 
 
 		 830 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  35.28 
 
 		 824 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  37.6 
 
 		 821 aa  296  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  32.83 
 
 		 801 aa  293  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  32.54 
 
 		 782 aa  293  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  39.04 
 
 		 879 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  28.06 
 
 		 385 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  26.48 
 
 		 404 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  25.82 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  26.17 
 
 		 358 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  25.61 
 
 		 368 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  25.68 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  25.75 
 
 		 368 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  25.75 
 
 		 368 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  25.61 
 
 		 368 aa  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  25.55 
 
 		 359 aa  107  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  26.87 
 
 		 358 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  24.73 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  24.73 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  24.73 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  24.73 
 
 		 369 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  25.39 
 
 		 382 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 420 aa  105  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.04 
 
 		 359 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  29.16 
 
 		 360 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  26.32 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  25.28 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  24.51 
 
 		 406 aa  101  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  24.86 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  23.69 
 
 		 389 aa  100  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  26.82 
 
 		 348 aa  100  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 359 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  27.78 
 
 		 393 aa  97.8  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  24.25 
 
 		 352 aa  96.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  25.36 
 
 		 349 aa  96.3  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  25.14 
 
 		 345 aa  96.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  26.61 
 
 		 368 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  24.25 
 
 		 352 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  25.79 
 
 		 372 aa  97.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  24.25 
 
 		 352 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  26.39 
 
 		 359 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  26.91 
 
 		 434 aa  96.3  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  25.36 
 
 		 349 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  25.41 
 
 		 389 aa  95.5  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.07 
 
 		 349 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 349 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  26.9 
 
 		 350 aa  94.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 353 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.07 
 
 		 349 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  24.79 
 
 		 349 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  24.79 
 
 		 349 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  26.14 
 
 		 349 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  27.57 
 
 		 374 aa  93.2  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  21.58 
 
 		 336 aa  92.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  28.32 
 
 		 350 aa  92  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  24.02 
 
 		 360 aa  92  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  26.82 
 
 		 406 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  26.82 
 
 		 388 aa  91.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  24.26 
 
 		 372 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  25.12 
 
 		 444 aa  91.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  25.85 
 
 		 349 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  25.85 
 
 		 349 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  23.42 
 
 		 338 aa  91.3  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  25.85 
 
 		 349 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>