More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0413 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  57.12 
 
 		 651 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  59.12 
 
 		 700 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  55.42 
 
 		 659 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  84.85 
 
 		 680 aa  1101    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  60.76 
 
 		 679 aa  763    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1324    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  56.96 
 
 		 651 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  61.33 
 
 		 668 aa  758    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  55.88 
 
 		 650 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  59.24 
 
 		 645 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  60.71 
 
 		 675 aa  754    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  52.27 
 
 		 677 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  51.8 
 
 		 680 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  48.67 
 
 		 660 aa  545  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  48.67 
 
 		 660 aa  545  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  48.4 
 
 		 652 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  47.85 
 
 		 662 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  48.08 
 
 		 660 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  49.29 
 
 		 653 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  44.15 
 
 		 647 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  48.21 
 
 		 689 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  44.19 
 
 		 650 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  44.32 
 
 		 650 aa  485  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  44.99 
 
 		 649 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  46.62 
 
 		 657 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  45.1 
 
 		 652 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  45.1 
 
 		 652 aa  458  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  44.73 
 
 		 606 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  46.38 
 
 		 647 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  41.07 
 
 		 805 aa  432  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  40.28 
 
 		 662 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  42.86 
 
 		 650 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  41.26 
 
 		 663 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  40.48 
 
 		 644 aa  415  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  37.83 
 
 		 801 aa  361  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  38.35 
 
 		 830 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  38.1 
 
 		 824 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  37.38 
 
 		 782 aa  352  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  37.37 
 
 		 821 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  39.52 
 
 		 879 aa  252  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  27.35 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  28.76 
 
 		 393 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  30.56 
 
 		 359 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  30.11 
 
 		 359 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  30.11 
 
 		 359 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  29.95 
 
 		 387 aa  121  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  26.72 
 
 		 420 aa  121  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  27.73 
 
 		 406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  27.73 
 
 		 388 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  28.22 
 
 		 393 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  28.98 
 
 		 338 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  25.47 
 
 		 389 aa  112  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  26.26 
 
 		 349 aa  111  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  26.5 
 
 		 374 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  26.76 
 
 		 357 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  25.59 
 
 		 405 aa  109  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  28.74 
 
 		 345 aa  109  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  36.84 
 
 		 366 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  27 
 
 		 434 aa  109  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  24.65 
 
 		 394 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  23.53 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  28.04 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  35.71 
 
 		 360 aa  106  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  27.82 
 
 		 406 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  27.6 
 
 		 434 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  26.84 
 
 		 390 aa  103  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  25.21 
 
 		 356 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  26.65 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  24.36 
 
 		 352 aa  102  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  24.36 
 
 		 352 aa  102  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  24.36 
 
 		 352 aa  102  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  27.5 
 
 		 349 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  24.38 
 
 		 359 aa  101  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  27.5 
 
 		 349 aa  101  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  27.5 
 
 		 349 aa  101  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  27.5 
 
 		 349 aa  101  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  27.5 
 
 		 349 aa  101  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  27.5 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  27.5 
 
 		 349 aa  101  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  27.5 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  27.5 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  31.68 
 
 		 361 aa  100  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  31.5 
 
 		 358 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  25.21 
 
 		 349 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  26.04 
 
 		 384 aa  98.2  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  26.11 
 
 		 394 aa  97.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  26.33 
 
 		 374 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  25.35 
 
 		 372 aa  97.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  24.93 
 
 		 349 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  24.93 
 
 		 349 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  23.62 
 
 		 373 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  24.93 
 
 		 349 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  26.11 
 
 		 368 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  22.64 
 
 		 369 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  25.2 
 
 		 350 aa  94.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  22.98 
 
 		 369 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  25.98 
 
 		 367 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  24.39 
 
 		 370 aa  93.2  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  22.73 
 
 		 369 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  24.93 
 
 		 349 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>