More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0719 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
370 aa  740    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  36.16 
 
 
372 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  34.31 
 
 
344 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  36.5 
 
 
352 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  36.5 
 
 
352 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  36.5 
 
 
352 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  34.4 
 
 
406 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  34.2 
 
 
404 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  34.96 
 
 
358 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  32.7 
 
 
368 aa  186  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  33.43 
 
 
368 aa  186  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  33.7 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  34.67 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  33.07 
 
 
382 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  33.72 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  33.72 
 
 
368 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  33.72 
 
 
368 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  32.88 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  32.88 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  34.59 
 
 
389 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  32.41 
 
 
369 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  33.43 
 
 
369 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  32.26 
 
 
344 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  32.26 
 
 
344 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  32.26 
 
 
344 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  32.26 
 
 
344 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  30.72 
 
 
350 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  32.26 
 
 
344 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  33.52 
 
 
349 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  33.24 
 
 
345 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  33.91 
 
 
359 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  31.44 
 
 
349 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  31.44 
 
 
349 aa  175  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  31.44 
 
 
349 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  31.44 
 
 
349 aa  175  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  31.44 
 
 
349 aa  175  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  31.44 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  31.44 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  31.44 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  32.35 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  31.44 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  34.51 
 
 
345 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  32.46 
 
 
348 aa  170  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  33.04 
 
 
361 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  35.42 
 
 
350 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  32.93 
 
 
350 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  31.34 
 
 
349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  31.34 
 
 
349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  31.34 
 
 
349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  32.39 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  32.54 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  33.04 
 
 
344 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  33.04 
 
 
344 aa  162  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  33.04 
 
 
344 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  31.82 
 
 
349 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  33.04 
 
 
344 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  33.04 
 
 
344 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  33.04 
 
 
344 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  33.04 
 
 
344 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  32.74 
 
 
344 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  32.74 
 
 
344 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  32.22 
 
 
360 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  31.47 
 
 
339 aa  155  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  30.42 
 
 
353 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  30.65 
 
 
336 aa  146  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  28.96 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  32.44 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  30.12 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  42.95 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  28.85 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  25.91 
 
 
358 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  25.51 
 
 
409 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  25.41 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  27.56 
 
 
362 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  27.45 
 
 
354 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  29.23 
 
 
350 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  25.36 
 
 
349 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  25.07 
 
 
342 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3908  hypothetical protein  28.35 
 
 
383 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  27.51 
 
 
362 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  25.28 
 
 
438 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  34.59 
 
 
350 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 
649 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  24.73 
 
 
679 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  27.67 
 
 
393 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1228  hypothetical protein  25.14 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  24.73 
 
 
668 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0793  hypothetical protein  26.35 
 
 
348 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  25.32 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  28.63 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  28.85 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  27.02 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3864  hypothetical protein  29.05 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285096  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  24.79 
 
 
805 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  26.06 
 
 
662 aa  92.8  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  25.4 
 
 
650 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  25.53 
 
 
659 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  30 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.229433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>