More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0359 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  682    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  32.18 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  31.98 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  32.16 
 
 
345 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  31.07 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  41.71 
 
 
354 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  31.74 
 
 
354 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  29.86 
 
 
372 aa  155  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  32.44 
 
 
382 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  30.95 
 
 
404 aa  152  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  31.95 
 
 
358 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  30.81 
 
 
358 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  30.7 
 
 
350 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  30.65 
 
 
359 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  30.77 
 
 
360 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  28.82 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  29.62 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  31.91 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  30.56 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  31.33 
 
 
369 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  31.33 
 
 
369 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  29.62 
 
 
344 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  29.62 
 
 
344 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  29.62 
 
 
344 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  30.86 
 
 
368 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  30.86 
 
 
368 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  31.33 
 
 
369 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  31.33 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1291  hypothetical protein  29.79 
 
 
351 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0482108  normal  0.0196495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  29.61 
 
 
345 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  31.14 
 
 
368 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  30.56 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  30.46 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  32.74 
 
 
361 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  29.79 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  31.4 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  29.11 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  30.7 
 
 
359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  30.93 
 
 
368 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  33.87 
 
 
362 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  30.89 
 
 
389 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  27.14 
 
 
352 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  27.14 
 
 
352 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  27.14 
 
 
352 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  25.89 
 
 
349 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  29.23 
 
 
350 aa  125  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  30 
 
 
344 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 
344 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  30 
 
 
344 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  30 
 
 
344 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  30 
 
 
344 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  28.44 
 
 
348 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  30 
 
 
344 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  30.29 
 
 
344 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  25.82 
 
 
349 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  25.82 
 
 
349 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.82 
 
 
349 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 
349 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.82 
 
 
349 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  25.82 
 
 
349 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.82 
 
 
349 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.82 
 
 
349 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  29.71 
 
 
344 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  25.82 
 
 
349 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  27.94 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  29.71 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  25.66 
 
 
349 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  25.66 
 
 
349 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  25.37 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  25.37 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  25.37 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  29.94 
 
 
361 aa  116  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  28.2 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  25.21 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  29.77 
 
 
370 aa  114  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  28.04 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  26.98 
 
 
398 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  24.93 
 
 
350 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  26.05 
 
 
336 aa  106  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  30.7 
 
 
338 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  26.06 
 
 
339 aa  102  9e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  26.9 
 
 
406 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 
662 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  26.18 
 
 
385 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  24.44 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  28.29 
 
 
357 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2135  protein of unknown function UPF0118  27.4 
 
 
443 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  22.89 
 
 
393 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1025  hypothetical protein  26.67 
 
 
406 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.297957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4918  protein of unknown function UPF0118  24.4 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  27.06 
 
 
663 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  24.24 
 
 
393 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  34.36 
 
 
606 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  28 
 
 
644 aa  86.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  26.37 
 
 
420 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  25.93 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  25.93 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  24.26 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  29.96 
 
 
824 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.397553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>