More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3357 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 358 aa  689    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  43.86 
 
 		 409 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  55.73 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  49.38 
 
 		 350 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2135  protein of unknown function UPF0118  49.07 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  40.4 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1025  hypothetical protein  46.38 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.297957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  40.47 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4918  protein of unknown function UPF0118  41.76 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  34.05 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  33.53 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  33.64 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  31.82 
 
 		 361 aa  153  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  29.39 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  32.12 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  32.12 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  32.12 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  31.9 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  32.93 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  31.69 
 
 		 360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  29.91 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  30.51 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  30.18 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  28.79 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  29.08 
 
 		 353 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  30.36 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  28.71 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  28.05 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  27.43 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  30.14 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  29.86 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  29.91 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  28.7 
 
 		 359 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  29.07 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  28.77 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  28.77 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  28.57 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  28.86 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  28.86 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  27.9 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  27.38 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  28.86 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  30.59 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  28.86 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  28.86 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  29.5 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  29.5 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  29.2 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  27.08 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  27.08 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  27.08 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  27.08 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  27.08 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  27.08 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  28.53 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  28.53 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  28.53 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  27.08 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  27.08 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  28.53 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  28.95 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  28.22 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  28.17 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  31.52 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  27.88 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  28.92 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  27.56 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  26.75 
 
 		 354 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  27.95 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  27.78 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  26.4 
 
 		 370 aa  119  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  27.78 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  24.55 
 
 		 349 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  28.52 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  28.52 
 
 		 344 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  28.52 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  28.52 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  28.52 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  28.52 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  28.52 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  28.52 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  28.52 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  27.52 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  27.15 
 
 		 662 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4788  hypothetical protein  27.18 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1291  hypothetical protein  28.12 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0482108  normal  0.0196495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  25.07 
 
 		 663 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  24.4 
 
 		 668 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  24.4 
 
 		 679 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  25.3 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  26.23 
 
 		 644 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 675 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  24.59 
 
 		 650 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  26.22 
 
 		 659 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  26.5 
 
 		 782 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3619  hypothetical protein  24.61 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542852  normal  0.0156067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  24.01 
 
 		 805 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  29.02 
 
 		 700 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  25.55 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>