More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1694 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  685    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  69.25 
 
 
361 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  40.83 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  43.2 
 
 
358 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  42.25 
 
 
359 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  41.77 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  43.47 
 
 
382 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  41.74 
 
 
368 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  43.11 
 
 
369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  42.81 
 
 
369 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  42.81 
 
 
369 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  42.81 
 
 
369 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  42.81 
 
 
368 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  42.04 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  42.04 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  44.11 
 
 
406 aa  239  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  40.84 
 
 
368 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  39.16 
 
 
404 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  40.91 
 
 
353 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  41.54 
 
 
361 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  39.17 
 
 
348 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  37.58 
 
 
345 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  42.55 
 
 
389 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  40.67 
 
 
372 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  38.86 
 
 
354 aa  215  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  43.25 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  42.07 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  36.99 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  38.9 
 
 
344 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  38.9 
 
 
344 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  38.9 
 
 
344 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  38.9 
 
 
344 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  37.83 
 
 
349 aa  208  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  38.9 
 
 
344 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  38.04 
 
 
344 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  38.53 
 
 
349 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  38.53 
 
 
349 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  38.24 
 
 
349 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  38.24 
 
 
349 aa  206  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  38.24 
 
 
349 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  38.24 
 
 
349 aa  206  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  38.24 
 
 
349 aa  206  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  37.94 
 
 
349 aa  205  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  37.94 
 
 
349 aa  205  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  38.42 
 
 
349 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  38.42 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  37.61 
 
 
352 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  37.61 
 
 
352 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  37.61 
 
 
352 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  38.12 
 
 
349 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  38.12 
 
 
349 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  38.12 
 
 
349 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  33.92 
 
 
350 aa  197  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  39.76 
 
 
350 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  33.53 
 
 
339 aa  193  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  33.13 
 
 
336 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  38.33 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  38.33 
 
 
344 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  38.33 
 
 
344 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  38.33 
 
 
344 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  38.33 
 
 
344 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  38.33 
 
 
344 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  38.04 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  38.04 
 
 
344 aa  182  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  38.04 
 
 
344 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  37.69 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  32.83 
 
 
359 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  34.15 
 
 
354 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  32.34 
 
 
370 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  28.61 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  30.7 
 
 
398 aa  152  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  34.74 
 
 
341 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  31.38 
 
 
358 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  27.7 
 
 
349 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  30 
 
 
354 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  27.08 
 
 
438 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  34.44 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  30.46 
 
 
350 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  30.89 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 
409 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  27.38 
 
 
362 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  30.26 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  30.23 
 
 
668 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 
675 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 
679 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  30.48 
 
 
352 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  30.48 
 
 
352 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  29.51 
 
 
650 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1025  hypothetical protein  30 
 
 
406 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.297957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 
650 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  29.65 
 
 
647 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4918  protein of unknown function UPF0118  26.83 
 
 
364 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  35.77 
 
 
390 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  29.33 
 
 
663 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  36.57 
 
 
700 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  33.46 
 
 
414 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  33.07 
 
 
432 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1291  hypothetical protein  26.46 
 
 
351 aa  99.4  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0482108  normal  0.0196495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1044  protein of unknown function UPF0118  32.67 
 
 
345 aa  99.4  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  27.03 
 
 
344 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>