More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2140 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  59.8 
 
 		 668 aa  780    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  59.1 
 
 		 680 aa  700    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  59.71 
 
 		 679 aa  783    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  59.73 
 
 		 679 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  61.88 
 
 		 675 aa  763    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  100 
 
 		 700 aa  1367    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  48.8 
 
 		 659 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  47.6 
 
 		 650 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  50 
 
 		 651 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  49.52 
 
 		 645 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  50.31 
 
 		 651 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  44.55 
 
 		 677 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  43.59 
 
 		 662 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  45.45 
 
 		 660 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  45.05 
 
 		 660 aa  487  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  45.05 
 
 		 660 aa  487  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  45.22 
 
 		 652 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  46.03 
 
 		 649 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  44.98 
 
 		 680 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  45.61 
 
 		 652 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  45.61 
 
 		 652 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  42.57 
 
 		 647 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  45.02 
 
 		 606 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  41.12 
 
 		 650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  45.12 
 
 		 689 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  43.14 
 
 		 653 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  40.12 
 
 		 650 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  41.38 
 
 		 805 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  43.78 
 
 		 647 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  43.54 
 
 		 657 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  43.21 
 
 		 650 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  39.72 
 
 		 663 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  39.43 
 
 		 662 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  42.07 
 
 		 644 aa  389  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  39.45 
 
 		 821 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  35.42 
 
 		 830 aa  325  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  34.86 
 
 		 824 aa  324  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  33.69 
 
 		 801 aa  321  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  32.79 
 
 		 782 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  32.46 
 
 		 879 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  28.76 
 
 		 393 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  26.91 
 
 		 420 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  29.14 
 
 		 385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  25.88 
 
 		 406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  25.88 
 
 		 388 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  27.42 
 
 		 393 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  27.23 
 
 		 359 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.02 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  25.87 
 
 		 405 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  27.58 
 
 		 359 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  26.16 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  27.93 
 
 		 390 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  25.53 
 
 		 394 aa  114  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  26.13 
 
 		 369 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  25.66 
 
 		 368 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  26.13 
 
 		 369 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  23.75 
 
 		 389 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  26.13 
 
 		 369 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  26.13 
 
 		 369 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  27 
 
 		 372 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  25.75 
 
 		 357 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  25.59 
 
 		 368 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  25.59 
 
 		 368 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  24.87 
 
 		 368 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  25.42 
 
 		 345 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  25.46 
 
 		 368 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  25.93 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  26.3 
 
 		 406 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  38.55 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  25.68 
 
 		 394 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  24.4 
 
 		 406 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  36.57 
 
 		 360 aa  103  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  31.05 
 
 		 382 aa  103  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 353 aa  102  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  27.3 
 
 		 338 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  30.46 
 
 		 358 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  25.7 
 
 		 344 aa  99.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  32.82 
 
 		 404 aa  99.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  23.75 
 
 		 372 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  32 
 
 		 359 aa  98.2  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  24.4 
 
 		 373 aa  97.8  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  34.36 
 
 		 349 aa  97.4  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  26.59 
 
 		 387 aa  97.4  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  33.51 
 
 		 358 aa  95.9  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  32.98 
 
 		 353 aa  96.3  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  25.81 
 
 		 444 aa  95.5  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  25.3 
 
 		 350 aa  95.1  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  33.33 
 
 		 349 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  38.51 
 
 		 349 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  38.51 
 
 		 349 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  38.51 
 
 		 349 aa  94  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  38.51 
 
 		 349 aa  94  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  38.51 
 
 		 349 aa  94  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  38.51 
 
 		 349 aa  94  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  38.51 
 
 		 349 aa  94  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  38.51 
 
 		 349 aa  94  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  38.51 
 
 		 349 aa  94  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  24.22 
 
 		 345 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  24.43 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  36.18 
 
 		 361 aa  92  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>