More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2158 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 653 aa  1293    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  48.04 
 
 		 652 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  47.58 
 
 		 659 aa  524  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  47.24 
 
 		 650 aa  525  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  46.64 
 
 		 662 aa  519  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  47.98 
 
 		 680 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  49.76 
 
 		 679 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  46.86 
 
 		 660 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  49.08 
 
 		 645 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  46.49 
 
 		 689 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  47.81 
 
 		 651 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  47.81 
 
 		 651 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  43.63 
 
 		 679 aa  482  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  43.63 
 
 		 668 aa  482  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  46.42 
 
 		 652 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  43.61 
 
 		 675 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  46.42 
 
 		 652 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  45.92 
 
 		 649 aa  475  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  46.69 
 
 		 606 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  44.23 
 
 		 660 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  44.23 
 
 		 660 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  41.92 
 
 		 677 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  45.18 
 
 		 657 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  42.66 
 
 		 680 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  45.72 
 
 		 647 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  41.95 
 
 		 647 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  42.81 
 
 		 650 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  41.97 
 
 		 805 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  43.49 
 
 		 650 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  43.2 
 
 		 700 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  41.9 
 
 		 650 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  38.47 
 
 		 663 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  38.94 
 
 		 662 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  39.87 
 
 		 644 aa  392  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  37.44 
 
 		 801 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  37.15 
 
 		 782 aa  362  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  36.18 
 
 		 830 aa  350  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  36.42 
 
 		 824 aa  350  4e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  37.99 
 
 		 821 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  33.81 
 
 		 879 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  28.68 
 
 		 385 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  27.92 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  27.7 
 
 		 388 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  28.45 
 
 		 393 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  27.82 
 
 		 349 aa  111  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  29.09 
 
 		 359 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  36.31 
 
 		 353 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  26.1 
 
 		 358 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  29.13 
 
 		 359 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  28.87 
 
 		 359 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  35.57 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  25.77 
 
 		 377 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  26.39 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  27.42 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  27.42 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  27.42 
 
 		 349 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  27.42 
 
 		 349 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  27.42 
 
 		 349 aa  102  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  27.42 
 
 		 349 aa  102  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  27.42 
 
 		 349 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  27.42 
 
 		 349 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  28.2 
 
 		 380 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  27.4 
 
 		 372 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  27.06 
 
 		 338 aa  100  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  33.76 
 
 		 366 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  24.86 
 
 		 390 aa  100  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  23.32 
 
 		 356 aa  99.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  28.93 
 
 		 405 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  23.12 
 
 		 394 aa  99.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  27.57 
 
 		 369 aa  99.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  23.47 
 
 		 369 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  23.16 
 
 		 389 aa  98.2  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  23.3 
 
 		 368 aa  97.8  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  23.56 
 
 		 369 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  23.56 
 
 		 369 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  23.56 
 
 		 369 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  26.33 
 
 		 349 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  30 
 
 		 382 aa  96.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  27.7 
 
 		 368 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  23.74 
 
 		 357 aa  97.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  25.06 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  26.57 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  31.96 
 
 		 387 aa  96.3  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  25.79 
 
 		 374 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  24.58 
 
 		 352 aa  94.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  24.58 
 
 		 352 aa  94.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  24.58 
 
 		 352 aa  94.7  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  24.05 
 
 		 404 aa  95.1  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  26.15 
 
 		 434 aa  94.4  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  25.21 
 
 		 382 aa  94.4  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  26.05 
 
 		 349 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  26.05 
 
 		 349 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  26.05 
 
 		 349 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  27.18 
 
 		 367 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  21.97 
 
 		 359 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  25.56 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  25.77 
 
 		 349 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  27.62 
 
 		 368 aa  92  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  22.25 
 
 		 368 aa  91.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>