More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2927 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  100 
 
 		 405 aa  800    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  60.45 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  62.64 
 
 		 390 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  60.27 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  58.12 
 
 		 420 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  62.19 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  48.72 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  41.32 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  40 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  40.76 
 
 		 393 aa  252  7e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  38.9 
 
 		 399 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3888  protein of unknown function UPF0118  35.93 
 
 		 439 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3776  protein of unknown function UPF0118  35.93 
 
 		 439 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  32.32 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  31.68 
 
 		 359 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  31.97 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  31.68 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  33.15 
 
 		 338 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  31.28 
 
 		 385 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  31.99 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  27.76 
 
 		 357 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  32.11 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  33.24 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  30.43 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  30.28 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  31.47 
 
 		 406 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  31.47 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  28.77 
 
 		 387 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  27.63 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  28.14 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  30.11 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  27.72 
 
 		 830 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  27.42 
 
 		 824 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  29.23 
 
 		 821 aa  126  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  27.1 
 
 		 805 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  26.49 
 
 		 662 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  27.43 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  27.82 
 
 		 662 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  24.6 
 
 		 663 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  27.27 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  29.28 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  29.93 
 
 		 650 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  26.34 
 
 		 680 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  27.07 
 
 		 606 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  27.49 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  29.67 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  25.52 
 
 		 668 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  26.53 
 
 		 660 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  25.52 
 
 		 679 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  26.45 
 
 		 657 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  29.05 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  25.74 
 
 		 675 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  24.52 
 
 		 652 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  24.52 
 
 		 652 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  29.18 
 
 		 653 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  24.79 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  26.13 
 
 		 700 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  28.72 
 
 		 659 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  24.63 
 
 		 647 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  26.67 
 
 		 644 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  24.55 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  26.35 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01555  transport protein  31.38 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  23.86 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  27.73 
 
 		 651 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  31.71 
 
 		 432 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  27.17 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  25.07 
 
 		 679 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  26.2 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  26.93 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  27.47 
 
 		 651 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  30.98 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  25.62 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  32.3 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  27.45 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  26.48 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  26.48 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  24.93 
 
 		 382 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  25.63 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  28.73 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  26.74 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  26.2 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  26.2 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  24.01 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  26.2 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  26.2 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  26.2 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.36 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  25.66 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  25.63 
 
 		 344 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  23.92 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 677 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  24.47 
 
 		 660 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  24.47 
 
 		 660 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  25.92 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  22.55 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  23.36 
 
 		 350 aa  97.8  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  24.13 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  36.48 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>