More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0246 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  100 
 
 		 369 aa  728    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  98.64 
 
 		 369 aa  718    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  68.05 
 
 		 338 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  65.32 
 
 		 369 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  33.69 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  29.67 
 
 		 357 aa  179  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  32.33 
 
 		 386 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  29.48 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  31.02 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  31.4 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  29.74 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  31.78 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  31.29 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  31.16 
 
 		 393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  31.29 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  30.6 
 
 		 408 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01555  transport protein  32.77 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  30.28 
 
 		 406 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  29.92 
 
 		 394 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  31.91 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  33.24 
 
 		 405 aa  145  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  31.18 
 
 		 393 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  31.67 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  27.84 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  29.52 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  27.24 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  24.72 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  27.54 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.22 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1324  hypothetical protein  30.42 
 
 		 408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0575147  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  26.99 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  27.07 
 
 		 663 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  25.14 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  24.09 
 
 		 374 aa  109  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 		 649 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  26.82 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  25.46 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  28.1 
 
 		 652 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 679 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  24.87 
 
 		 675 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  26.42 
 
 		 668 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  28.28 
 
 		 650 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  27.82 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  29.46 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  26.49 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  27.96 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 662 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  25.5 
 
 		 606 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  24.08 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  26.23 
 
 		 662 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  24.02 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  25.6 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0484  hypothetical protein  28.26 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  28.72 
 
 		 659 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  25.55 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  25.58 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  26.51 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  27.41 
 
 		 647 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  25.86 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  26.29 
 
 		 374 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  27.58 
 
 		 651 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  24.31 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  27.58 
 
 		 651 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.92 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  22.25 
 
 		 365 aa  93.2  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.3 
 
 		 390 aa  93.2  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  26.14 
 
 		 679 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  26.42 
 
 		 644 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 680 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.82 
 
 		 405 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  30.05 
 
 		 650 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.08 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.08 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  30.05 
 
 		 650 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  24.13 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  30.37 
 
 		 645 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  27.37 
 
 		 650 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  26.21 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.69 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.69 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.69 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.69 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  22.49 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  23.49 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  26.38 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  27.78 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  23.96 
 
 		 660 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  23.96 
 
 		 660 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  24.77 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  24.77 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 		 677 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>