More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2927 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2927  permease  100 
 
 
365 aa  719    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  51.1 
 
 
387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  43.06 
 
 
373 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  49.86 
 
 
360 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  43.47 
 
 
354 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  37.57 
 
 
366 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  36.46 
 
 
377 aa  225  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  36.42 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  34.99 
 
 
370 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  35.09 
 
 
367 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  33.33 
 
 
371 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  30.48 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  30.3 
 
 
363 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  26.98 
 
 
371 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  26.84 
 
 
380 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  27.53 
 
 
373 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  27.22 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.9 
 
 
373 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.53 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.43 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  27.22 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  27.22 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  27.22 
 
 
376 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  27.22 
 
 
376 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  27.22 
 
 
376 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  26.9 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.68 
 
 
349 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.01 
 
 
369 aa  115  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  30.37 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  29.65 
 
 
368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.88 
 
 
341 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 
386 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.3 
 
 
405 aa  106  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.23 
 
 
343 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.58 
 
 
349 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  25.67 
 
 
358 aa  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.04 
 
 
402 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.04 
 
 
402 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  25.68 
 
 
805 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.58 
 
 
396 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  25.94 
 
 
368 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  24.51 
 
 
345 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  26.96 
 
 
336 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 
392 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 
354 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.12 
 
 
348 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.92 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  25.15 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 
355 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.69 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  24.69 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.92 
 
 
348 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.77 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  25.79 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.92 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.92 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  26.26 
 
 
659 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.92 
 
 
361 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.71 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.99 
 
 
358 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25.55 
 
 
372 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  26.3 
 
 
390 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  26.92 
 
 
393 aa  96.3  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.28 
 
 
361 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.28 
 
 
361 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 
372 aa  96.3  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.28 
 
 
361 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.28 
 
 
348 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.88 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  26.3 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.89 
 
 
404 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  27.87 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.46 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  25.22 
 
 
830 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.95 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  25.13 
 
 
668 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  25.13 
 
 
679 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  27.58 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  26.33 
 
 
434 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  24.73 
 
 
393 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  27.04 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.13 
 
 
329 aa  93.2  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  27.22 
 
 
375 aa  92.8  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.29 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  28.53 
 
 
350 aa  92.8  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  26.69 
 
 
363 aa  92.8  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  24.64 
 
 
824 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  24.14 
 
 
650 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  26.58 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 
448 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  26.37 
 
 
346 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  24.69 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  24.61 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.08 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  27.79 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  28.27 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  24.04 
 
 
344 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  24.5 
 
 
821 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  24.69 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>