More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2954 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  768    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  45.58 
 
 		 384 aa  326  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  42.73 
 
 		 389 aa  295  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  38.06 
 
 		 420 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  38.89 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  36.77 
 
 		 394 aa  279  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  38.5 
 
 		 390 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  40 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  38.33 
 
 		 434 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  36.86 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  35.64 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3888  protein of unknown function UPF0118  33.98 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3776  protein of unknown function UPF0118  33.98 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  28.42 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.39 
 
 		 359 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  29.29 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  25.87 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  27.59 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  29.48 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  28.12 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  27.75 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  28.34 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  28.34 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  28.17 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  28.03 
 
 		 338 aa  120  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  26.76 
 
 		 369 aa  120  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  27.64 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  24.64 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  26 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  27.81 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  26.8 
 
 		 663 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  29.02 
 
 		 805 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  27.72 
 
 		 662 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  26.19 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  26 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  25.97 
 
 		 644 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  25.48 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 		 652 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  26.73 
 
 		 830 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  26.43 
 
 		 824 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 649 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  27.27 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 662 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  24.29 
 
 		 680 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  25.41 
 
 		 647 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  27.43 
 
 		 650 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  26.32 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  27.94 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  28.07 
 
 		 650 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  25.94 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  27.3 
 
 		 355 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  28.13 
 
 		 362 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  25.27 
 
 		 368 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  27.3 
 
 		 355 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  28.13 
 
 		 362 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  28.13 
 
 		 362 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  25.5 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  25.23 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  25.23 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  25.23 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  25.67 
 
 		 679 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  25.4 
 
 		 668 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  26.7 
 
 		 606 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  26.49 
 
 		 374 aa  93.6  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  23.65 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  22.9 
 
 		 782 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  27.83 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  27.83 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  27.83 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.83 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  27.83 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  27.83 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  27.83 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  27.83 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  24.32 
 
 		 444 aa  92.8  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  25.75 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  27.49 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 650 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.35 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  25.5 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  24.72 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  25.07 
 
 		 679 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  25.93 
 
 		 660 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  34 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  25.41 
 
 		 675 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  22.28 
 
 		 801 aa  89.7  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  24.94 
 
 		 660 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  23.61 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  24.94 
 
 		 660 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  24.32 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  27.33 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  23.06 
 
 		 821 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  22.42 
 
 		 361 aa  87  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  27.74 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  27.74 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>