More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1696 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  98.67 
 
 		 824 aa  1608    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  47.8 
 
 		 801 aa  696    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  46.94 
 
 		 782 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 830 aa  1637    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  49.81 
 
 		 879 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  43.46 
 
 		 805 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  41.53 
 
 		 663 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  40.68 
 
 		 644 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  39.87 
 
 		 662 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  39.27 
 
 		 662 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  35.21 
 
 		 821 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  39.29 
 
 		 660 aa  366  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  37.95 
 
 		 652 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  37.38 
 
 		 650 aa  352  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  38.15 
 
 		 647 aa  345  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  38.29 
 
 		 680 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  37.84 
 
 		 651 aa  335  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  38.55 
 
 		 606 aa  335  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  37.84 
 
 		 651 aa  333  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  38.35 
 
 		 679 aa  333  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  36.01 
 
 		 659 aa  333  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  38.63 
 
 		 645 aa  333  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  36.05 
 
 		 675 aa  327  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  36.02 
 
 		 653 aa  324  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  35.55 
 
 		 679 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  36.12 
 
 		 668 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  36.14 
 
 		 660 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  36.14 
 
 		 660 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  35.46 
 
 		 680 aa  319  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  35.35 
 
 		 677 aa  316  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  38.11 
 
 		 689 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  35.6 
 
 		 650 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  34.82 
 
 		 652 aa  313  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  34.69 
 
 		 650 aa  313  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  34.82 
 
 		 652 aa  312  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  35.65 
 
 		 649 aa  310  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  37.73 
 
 		 647 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  34.09 
 
 		 657 aa  294  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  37.28 
 
 		 700 aa  283  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  37.12 
 
 		 650 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  27.27 
 
 		 385 aa  123  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  25.14 
 
 		 393 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  27.2 
 
 		 405 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  27.5 
 
 		 345 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  24.23 
 
 		 394 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25.45 
 
 		 420 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 681 aa  114  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  27.51 
 
 		 393 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  29.33 
 
 		 352 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  29.33 
 
 		 352 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.84 
 
 		 348 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.84 
 
 		 348 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  29.33 
 
 		 352 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.03 
 
 		 878 aa  112  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  39.16 
 
 		 316 aa  112  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  30.55 
 
 		 350 aa  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  28.57 
 
 		 374 aa  107  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  27.56 
 
 		 384 aa  107  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  29.14 
 
 		 359 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  28.21 
 
 		 353 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  26.44 
 
 		 344 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  26.44 
 
 		 344 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2169  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.92 
 
 		 722 aa  106  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0648584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  26.44 
 
 		 344 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  25.36 
 
 		 344 aa  105  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  26.44 
 
 		 344 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.92 
 
 		 722 aa  104  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  26.15 
 
 		 344 aa  104  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  25.54 
 
 		 357 aa  104  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  29.39 
 
 		 358 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 		 359 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  25.59 
 
 		 349 aa  103  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  26.38 
 
 		 356 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  26.44 
 
 		 434 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  27.48 
 
 		 359 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  27.87 
 
 		 359 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2011  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.96 
 
 		 321 aa  102  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0323841  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  26.35 
 
 		 390 aa  100  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  27.2 
 
 		 394 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  28.74 
 
 		 406 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  27.93 
 
 		 354 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 321 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  25.62 
 
 		 382 aa  99.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 697 aa  99.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  37.74 
 
 		 732 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.34 
 
 		 321 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  26.45 
 
 		 373 aa  98.2  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  28.28 
 
 		 434 aa  98.2  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.61 
 
 		 319 aa  97.8  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  24.23 
 
 		 406 aa  97.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.91 
 
 		 722 aa  97.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 680 aa  96.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  24.23 
 
 		 388 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  40.36 
 
 		 595 aa  95.9  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  39.33 
 
 		 327 aa  95.9  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.03 
 
 		 318 aa  95.1  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  25.22 
 
 		 365 aa  95.5  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  37.2 
 
 		 343 aa  95.1  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 401 aa  94.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  23.43 
 
 		 389 aa  94.4  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>