More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5287 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 677 aa  1344    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  85.04 
 
 		 680 aa  1089    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  49.7 
 
 		 650 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  51.25 
 
 		 680 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  52.27 
 
 		 679 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  51.63 
 
 		 645 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  48.67 
 
 		 659 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  48.48 
 
 		 650 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  49.3 
 
 		 651 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  49.09 
 
 		 651 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  48.98 
 
 		 650 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  47.13 
 
 		 647 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  47.69 
 
 		 679 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  47.69 
 
 		 668 aa  548  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  46.9 
 
 		 675 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  48.1 
 
 		 660 aa  538  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  48.1 
 
 		 660 aa  538  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  45.95 
 
 		 700 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  44.23 
 
 		 652 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  42.68 
 
 		 660 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  44.24 
 
 		 650 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  42.39 
 
 		 662 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  41.6 
 
 		 653 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  43.15 
 
 		 689 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  42.83 
 
 		 657 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  40.82 
 
 		 649 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  39.81 
 
 		 652 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  41.23 
 
 		 647 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  39.81 
 
 		 652 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  38.8 
 
 		 606 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  38.84 
 
 		 805 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  38.37 
 
 		 663 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  36.25 
 
 		 644 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  34.57 
 
 		 662 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  35.35 
 
 		 830 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  35.32 
 
 		 824 aa  335  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  36.36 
 
 		 821 aa  319  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  34.1 
 
 		 801 aa  313  7.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  33.23 
 
 		 782 aa  310  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  38.39 
 
 		 879 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  28.99 
 
 		 393 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 		 420 aa  127  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  28.18 
 
 		 406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  28.18 
 
 		 388 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  24.8 
 
 		 385 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  26.13 
 
 		 405 aa  109  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  28.43 
 
 		 393 aa  105  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  27.49 
 
 		 357 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  26.2 
 
 		 372 aa  104  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  26.53 
 
 		 359 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  26.53 
 
 		 389 aa  103  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  30.14 
 
 		 390 aa  103  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  33.8 
 
 		 361 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  27.37 
 
 		 338 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 353 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  34.45 
 
 		 360 aa  101  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 		 359 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 359 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  27.81 
 
 		 387 aa  100  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  25.47 
 
 		 338 aa  100  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  25.42 
 
 		 366 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  24.21 
 
 		 368 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  27.1 
 
 		 369 aa  99  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  24.72 
 
 		 372 aa  98.6  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  23.63 
 
 		 394 aa  98.2  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  25.57 
 
 		 345 aa  98.2  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  24.18 
 
 		 359 aa  98.2  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  27.95 
 
 		 358 aa  97.4  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  24.18 
 
 		 345 aa  97.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  25.42 
 
 		 360 aa  95.9  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  24.36 
 
 		 356 aa  96.3  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  22.13 
 
 		 336 aa  95.1  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  20.97 
 
 		 339 aa  95.5  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  25.2 
 
 		 367 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  26.26 
 
 		 374 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  26.04 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  23.55 
 
 		 382 aa  92  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  21.78 
 
 		 369 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  25.71 
 
 		 344 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  23.68 
 
 		 373 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  25.63 
 
 		 406 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  31.58 
 
 		 353 aa  90.1  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0992  protein of unknown function UPF0118  26.06 
 
 		 396 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.537691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  25.43 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  24.66 
 
 		 384 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  25.43 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  23.24 
 
 		 404 aa  89.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  24.86 
 
 		 349 aa  89.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  25.43 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  21.62 
 
 		 369 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  23.26 
 
 		 352 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  23.26 
 
 		 352 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  23.26 
 
 		 352 aa  88.6  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  23.26 
 
 		 374 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  25.52 
 
 		 394 aa  88.6  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  21.47 
 
 		 369 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  21.47 
 
 		 369 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  25.43 
 
 		 344 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  25.79 
 
 		 438 aa  87.4  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  25.27 
 
 		 368 aa  87  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>