More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4214 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  99.69 
 
 		 652 aa  1258    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  100 
 
 		 652 aa  1262    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  64.3 
 
 		 647 aa  724    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  91.54 
 
 		 649 aa  1121    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  66.56 
 
 		 657 aa  766    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  50.08 
 
 		 652 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  49.3 
 
 		 689 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  47.86 
 
 		 651 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  47.7 
 
 		 651 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  45.37 
 
 		 650 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  45.04 
 
 		 659 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  47.8 
 
 		 645 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  46.07 
 
 		 606 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  45.14 
 
 		 668 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  45.14 
 
 		 679 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  44.6 
 
 		 675 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  45.66 
 
 		 653 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  45.02 
 
 		 662 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  46.29 
 
 		 660 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  45.22 
 
 		 680 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  45.38 
 
 		 700 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  44.24 
 
 		 679 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  41.13 
 
 		 805 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  42.75 
 
 		 660 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  42.75 
 
 		 660 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  41.54 
 
 		 650 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  39.69 
 
 		 647 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  41.1 
 
 		 650 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  39.69 
 
 		 677 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  38.52 
 
 		 663 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  39.27 
 
 		 680 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  38.47 
 
 		 662 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  37.44 
 
 		 644 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  40.25 
 
 		 650 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  37.65 
 
 		 821 aa  350  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  34.82 
 
 		 830 aa  323  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  34.68 
 
 		 824 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  34.07 
 
 		 801 aa  313  9e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  33.55 
 
 		 782 aa  298  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  41.94 
 
 		 879 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  28.76 
 
 		 420 aa  144  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  27.12 
 
 		 385 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  28.72 
 
 		 393 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  28.02 
 
 		 393 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  29.72 
 
 		 384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  29.86 
 
 		 353 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  26.96 
 
 		 394 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  23.94 
 
 		 389 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  25.96 
 
 		 406 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  25.96 
 
 		 388 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  28.86 
 
 		 359 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  27.62 
 
 		 390 aa  114  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  26.53 
 
 		 406 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  28.11 
 
 		 434 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  27.43 
 
 		 359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 359 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  28.49 
 
 		 366 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  25.68 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.23 
 
 		 389 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  26.61 
 
 		 373 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  28.07 
 
 		 345 aa  107  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  27.04 
 
 		 338 aa  107  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  25.07 
 
 		 368 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  24.37 
 
 		 357 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  24.21 
 
 		 405 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  26.29 
 
 		 356 aa  105  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  27.25 
 
 		 434 aa  104  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  25.5 
 
 		 359 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  24.21 
 
 		 394 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  25.51 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  24.86 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  26.92 
 
 		 349 aa  102  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  25.07 
 
 		 368 aa  101  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  26.54 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  26.48 
 
 		 358 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  26.09 
 
 		 339 aa  100  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  24.86 
 
 		 374 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  26.07 
 
 		 368 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  26.07 
 
 		 368 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  25.79 
 
 		 368 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  25.21 
 
 		 406 aa  99.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  24.79 
 
 		 367 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  27.57 
 
 		 344 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  27.22 
 
 		 374 aa  98.6  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  27.57 
 
 		 344 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  27.57 
 
 		 344 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  27.57 
 
 		 344 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  24.65 
 
 		 369 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  24.65 
 
 		 369 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  24.65 
 
 		 369 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  24.65 
 
 		 369 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  27.47 
 
 		 349 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  27.47 
 
 		 349 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  27.47 
 
 		 349 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  27.47 
 
 		 349 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  25.95 
 
 		 370 aa  96.3  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  27.47 
 
 		 349 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  27.47 
 
 		 349 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  27.47 
 
 		 349 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  25.94 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>