More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4731 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 649 aa  1251    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  92.64 
 
 		 652 aa  1097    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  92.64 
 
 		 652 aa  1098    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  66.82 
 
 		 657 aa  767    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  67.07 
 
 		 647 aa  739    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  49.92 
 
 		 652 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  45.62 
 
 		 650 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  45.83 
 
 		 668 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  45.83 
 
 		 679 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  45.18 
 
 		 659 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  46.31 
 
 		 606 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  48.66 
 
 		 689 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  46.36 
 
 		 660 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  47.76 
 
 		 645 aa  485  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  48.01 
 
 		 651 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  45.98 
 
 		 662 aa  485  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  47.85 
 
 		 651 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  46.09 
 
 		 675 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  45.91 
 
 		 653 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  44.98 
 
 		 680 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  45.71 
 
 		 679 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  46.59 
 
 		 700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  41.29 
 
 		 805 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  40.99 
 
 		 660 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  40.99 
 
 		 660 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  41.37 
 
 		 650 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  41.37 
 
 		 650 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  39.6 
 
 		 647 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  40.82 
 
 		 677 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  40.21 
 
 		 680 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  38.88 
 
 		 663 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  37.83 
 
 		 662 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  36.64 
 
 		 644 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  40.28 
 
 		 650 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  37.54 
 
 		 821 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  35.65 
 
 		 830 aa  316  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  35.05 
 
 		 824 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  34.93 
 
 		 801 aa  312  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  33.6 
 
 		 782 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  39.44 
 
 		 879 aa  259  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  29.17 
 
 		 420 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  27.53 
 
 		 385 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  28.87 
 
 		 393 aa  130  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  29.33 
 
 		 384 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  28.17 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  26.46 
 
 		 394 aa  123  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 353 aa  123  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  26.4 
 
 		 406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  26.4 
 
 		 388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  27.58 
 
 		 390 aa  117  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  24.93 
 
 		 389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  26.98 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  26.72 
 
 		 359 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  25.7 
 
 		 357 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.14 
 
 		 359 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.36 
 
 		 389 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  27.2 
 
 		 382 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  27.79 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  26.61 
 
 		 359 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 373 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  28.99 
 
 		 345 aa  111  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  28.28 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  24.51 
 
 		 405 aa  109  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  27.61 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  28.49 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  26.01 
 
 		 356 aa  108  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  25.27 
 
 		 368 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  26.69 
 
 		 394 aa  107  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  27.7 
 
 		 359 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  25.55 
 
 		 367 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  27.62 
 
 		 349 aa  105  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  26.1 
 
 		 358 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  25.81 
 
 		 368 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  27.68 
 
 		 374 aa  103  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 		 370 aa  103  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  24.36 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  25.62 
 
 		 368 aa  101  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  24.43 
 
 		 372 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  26.26 
 
 		 406 aa  101  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  27.07 
 
 		 349 aa  100  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  27.07 
 
 		 349 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  25.68 
 
 		 339 aa  100  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  25.42 
 
 		 377 aa  100  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  27.07 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  27.07 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  27.07 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  27.07 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  27.07 
 
 		 349 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  27.62 
 
 		 349 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  24.24 
 
 		 380 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  27.95 
 
 		 369 aa  97.4  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  25.81 
 
 		 368 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  25.81 
 
 		 368 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  27.79 
 
 		 372 aa  97.4  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  25.51 
 
 		 368 aa  97.4  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  26.02 
 
 		 352 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  26.02 
 
 		 352 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  26.8 
 
 		 349 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  25 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>