More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6648 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 805 aa  1603    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  43.72 
 
 		 824 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  43.46 
 
 		 830 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  39.97 
 
 		 801 aa  525  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  38.94 
 
 		 782 aa  514  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  46.14 
 
 		 663 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  44.43 
 
 		 662 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  39.05 
 
 		 821 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  44.44 
 
 		 644 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  44.08 
 
 		 662 aa  479  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  42.69 
 
 		 660 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  41.54 
 
 		 652 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  39.75 
 
 		 650 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  41.54 
 
 		 659 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3382  putative phytochrome sensor protein  39.09 
 
 		 879 aa  446  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1866  hypothetical protein  44.96 
 
 		 689 aa  439  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  42.93 
 
 		 606 aa  432  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  41.16 
 
 		 645 aa  429  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  42.79 
 
 		 651 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  41.19 
 
 		 652 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  41.45 
 
 		 652 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  41.29 
 
 		 649 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  41.81 
 
 		 653 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  40.28 
 
 		 680 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  42.63 
 
 		 651 aa  412  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  39.04 
 
 		 668 aa  412  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  39.04 
 
 		 679 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0413  hypothetical protein  42.57 
 
 		 679 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  38.99 
 
 		 675 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  40.03 
 
 		 660 aa  406  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3196  hypothetical protein  40.03 
 
 		 660 aa  406  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  37.96 
 
 		 647 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  39.35 
 
 		 657 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  41.95 
 
 		 700 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5287  protein of unknown function UPF0118  38.84 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  39.67 
 
 		 647 aa  376  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  35.83 
 
 		 650 aa  365  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  35.05 
 
 		 650 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1324  membrane transporter  36.18 
 
 		 680 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542629  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  38.98 
 
 		 650 aa  335  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  29.43 
 
 		 393 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  29.47 
 
 		 420 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  25.81 
 
 		 385 aa  124  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  27.82 
 
 		 394 aa  124  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  28.88 
 
 		 382 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  28.93 
 
 		 344 aa  120  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  30.5 
 
 		 352 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  30.5 
 
 		 352 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  30.5 
 
 		 352 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  27.25 
 
 		 372 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  27.73 
 
 		 390 aa  119  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  27.25 
 
 		 393 aa  118  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  28.8 
 
 		 394 aa  118  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  30.47 
 
 		 389 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  26.5 
 
 		 405 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  29.09 
 
 		 345 aa  115  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.84 
 
 		 359 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  25.61 
 
 		 389 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 		 359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  27.87 
 
 		 358 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  31.29 
 
 		 350 aa  112  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  27.37 
 
 		 359 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  28.21 
 
 		 344 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 		 878 aa  111  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  28.72 
 
 		 358 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.21 
 
 		 348 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.21 
 
 		 348 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  26.56 
 
 		 368 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  28.21 
 
 		 344 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  28.21 
 
 		 344 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  28.21 
 
 		 344 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 373 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  26.74 
 
 		 345 aa  109  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  22.68 
 
 		 387 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  27.92 
 
 		 344 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  27.2 
 
 		 368 aa  109  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  25.22 
 
 		 356 aa  109  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  24.93 
 
 		 404 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  40.49 
 
 		 316 aa  107  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  40.22 
 
 		 669 aa  107  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  24.09 
 
 		 406 aa  107  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  28.41 
 
 		 372 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  28.53 
 
 		 359 aa  107  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.94 
 
 		 728 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  25.94 
 
 		 349 aa  107  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  27.27 
 
 		 434 aa  106  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  24.09 
 
 		 388 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  30.06 
 
 		 406 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 		 680 aa  105  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 681 aa  105  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  26.36 
 
 		 368 aa  104  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.31 
 
 		 1423 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.52 
 
 		 321 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  26.63 
 
 		 406 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  26.02 
 
 		 368 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  26.02 
 
 		 368 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  26.36 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  25.57 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  26.36 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  27.59 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>