More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0136 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 387 aa  763    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  61.7 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  51.1 
 
 		 365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  44.1 
 
 		 373 aa  292  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  45.03 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  40.97 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  35.96 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  34.08 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  34.75 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  32.31 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  30.86 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  31.89 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  30.86 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  22.73 
 
 		 805 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  25.78 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  23.12 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.6 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.74 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  24.92 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.75 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  30.57 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  25.16 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  26.1 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  26.35 
 
 		 344 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  27.08 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  26.35 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  26.35 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  25.9 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  23.34 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  26.35 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  26.35 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.67 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.95 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  24.32 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  25.4 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  22.54 
 
 		 821 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.21 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  21.74 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  28.44 
 
 		 361 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  24.72 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  23.68 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  26.98 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  26.58 
 
 		 373 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.52 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  28.81 
 
 		 345 aa  97.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.58 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  26.58 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.58 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  26.58 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.58 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.64 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  27.87 
 
 		 352 aa  96.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 417 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  27.87 
 
 		 352 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  24.7 
 
 		 349 aa  96.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  27.87 
 
 		 352 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.57 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.57 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  23.96 
 
 		 393 aa  96.3  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.57 
 
 		 361 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.57 
 
 		 348 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  23.27 
 
 		 380 aa  96.3  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.57 
 
 		 361 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  26.57 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 529 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.27 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  26.9 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  26.27 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  28.21 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.22 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.22 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.22 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  25.95 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.22 
 
 		 348 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  23.29 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.15 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 		 354 aa  94  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.26 
 
 		 349 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  24.46 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  24.46 
 
 		 349 aa  93.6  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  23.19 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.6 
 
 		 405 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  24.46 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  24.46 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.1 
 
 		 344 aa  92.8  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  24.46 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  24.46 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  24.46 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  24.46 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.02 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.31 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  25.92 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  22.39 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  25.78 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  25.92 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  28.17 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  25.92 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  25.92 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>