More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1233 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 370 aa  734    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  42.3 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  34.99 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  37.67 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  34.15 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  39.1 
 
 		 354 aa  229  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  35.59 
 
 		 387 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  31.68 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  34.1 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  30.95 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  29.47 
 
 		 371 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  27.66 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  30.75 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  25.61 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  24.55 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  25.66 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.85 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.1 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25.37 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  26.78 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  25.62 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25.69 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  22.96 
 
 		 356 aa  92.8  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  22.29 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.73 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  25.23 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  22.91 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.7 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  22.63 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  27.97 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  21.94 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  25.67 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.01 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  26.25 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  28.49 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  24.44 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  24.52 
 
 		 394 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  25.56 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.56 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  22.25 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  24.15 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  25.33 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  24.55 
 
 		 487 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  24.8 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  25.33 
 
 		 381 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  24.4 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  25.33 
 
 		 381 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  24.84 
 
 		 359 aa  86.3  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.38 
 
 		 348 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  24.55 
 
 		 372 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  25.24 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.56 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  22.39 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  22.32 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.92 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.92 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  24.92 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  24.92 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  24.92 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  24.92 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  25.66 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  23.85 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  25.45 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  21.2 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  26.38 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.55 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  29.57 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  23.86 
 
 		 383 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.32 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  23.68 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  23.98 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  23.16 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0662  protein of unknown function UPF0118  25.89 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.84 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  21.39 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  24.01 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.23 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  26.21 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  21.02 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.78 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25.16 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.78 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  22.76 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  25.69 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.48 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.48 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.48 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.48 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  28.26 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  23.63 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  25.63 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.39 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  22.62 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  24.38 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  22.49 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>