More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1880 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  97.83 
 
 		 368 aa  708    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  731    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  40.33 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  39.51 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  35.12 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  41.22 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  30.14 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  29.75 
 
 		 391 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  31.85 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  27.91 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  28.04 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  30.74 
 
 		 345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 		 407 aa  143  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  28.77 
 
 		 371 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.7 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.48 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  27.23 
 
 		 540 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  30.09 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.54 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.75 
 
 		 361 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.98 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.74 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.74 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.93 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.27 
 
 		 361 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.27 
 
 		 361 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.27 
 
 		 361 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  26.39 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  27.16 
 
 		 345 aa  125  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  27.72 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  28.37 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  28.37 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  28.37 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.02 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  28.37 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.84 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  28.65 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  28.37 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  29.32 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.33 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  28.37 
 
 		 373 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.15 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  29.01 
 
 		 373 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 		 354 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  28.16 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  28.09 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  28.02 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0411  protein of unknown function UPF0118  24.26 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  27.73 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  27.16 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.6 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  24.48 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.54 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.54 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.54 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.54 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.54 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  24.41 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  25.63 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.2 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.2 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.28 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  26.17 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.64 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.36 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  25.85 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  25.36 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  27.09 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.05 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.39 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  26.52 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  24.55 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  25.23 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.48 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  27.67 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  25.5 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.76 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.48 
 
 		 402 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.48 
 
 		 402 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25.65 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  24.18 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  24.18 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  23.35 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.95 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  23.03 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  26.23 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1751  permease  26.94 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.976509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  25.45 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  24.48 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  25.55 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  24.21 
 
 		 374 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  25.14 
 
 		 424 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  24.28 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>