More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0457 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  732    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  86.42 
 
 
384 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  75.13 
 
 
381 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  75.13 
 
 
381 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  75.13 
 
 
381 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  64.2 
 
 
367 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  54.64 
 
 
390 aa  349  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  45.58 
 
 
457 aa  298  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  49.28 
 
 
487 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  48.84 
 
 
423 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  49.48 
 
 
402 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  50.14 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  45.29 
 
 
421 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  49.28 
 
 
439 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  44.99 
 
 
464 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  45.51 
 
 
452 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  42.98 
 
 
455 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  45.09 
 
 
421 aa  249  8e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  45.22 
 
 
420 aa  242  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  38.15 
 
 
477 aa  233  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  47.48 
 
 
475 aa  232  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  45.54 
 
 
415 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  42.36 
 
 
483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  38.02 
 
 
367 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  39.72 
 
 
405 aa  206  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  36.77 
 
 
436 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  38.84 
 
 
407 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  42.36 
 
 
396 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  37.96 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  37.72 
 
 
397 aa  196  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  40.61 
 
 
387 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  39.09 
 
 
429 aa  189  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  33.25 
 
 
435 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  36.81 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  35.47 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  35.67 
 
 
423 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  32.36 
 
 
426 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  36.89 
 
 
418 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  41.04 
 
 
384 aa  166  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  33.04 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  39.76 
 
 
432 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  37.24 
 
 
376 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  35.33 
 
 
376 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  35.33 
 
 
376 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  33.94 
 
 
444 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  34.72 
 
 
394 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  39.55 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  32.54 
 
 
476 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  32.06 
 
 
390 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  37.62 
 
 
355 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  32.51 
 
 
416 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  36.59 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  33.53 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.82 
 
 
354 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  31.27 
 
 
529 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  35.21 
 
 
389 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  31.66 
 
 
400 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  31.73 
 
 
371 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.89 
 
 
390 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.48 
 
 
402 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.48 
 
 
402 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  28.11 
 
 
388 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  26.86 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.63 
 
 
389 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.78 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  29.54 
 
 
415 aa  96.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.92 
 
 
396 aa  95.9  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  32.81 
 
 
383 aa  96.3  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  31.75 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  25.92 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  29.09 
 
 
369 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 
436 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.5 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  28.35 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  29.07 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 
455 aa  89.7  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  27.81 
 
 
362 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  29.48 
 
 
358 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  29.04 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.73 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 
354 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.13 
 
 
363 aa  87  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  26.89 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  29.73 
 
 
365 aa  86.7  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.75 
 
 
424 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  26.23 
 
 
329 aa  86.3  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.68 
 
 
435 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.95 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  30.61 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  29.09 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.97 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  31.06 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.95 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  24.67 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  26.05 
 
 
526 aa  84.3  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  26.53 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.12 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  26.26 
 
 
452 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>