More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0662 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0662  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 372 aa  716    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  27.62 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  28.27 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.98 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  31.51 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  28.04 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  32.24 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  27.27 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.01 
 
 		 341 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  26.98 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.01 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.62 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.15 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.15 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.54 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  30.91 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  26.83 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  27.41 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  25.16 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  28.04 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.23 
 
 		 396 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  29.47 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.77 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  29.91 
 
 		 356 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.36 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  29.23 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.6 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  29.58 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  29.49 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  29.49 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  29.49 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  29.49 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  27.97 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0071  protein of unknown function UPF0118  23.89 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  30.42 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  29.03 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  29.87 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  27.92 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  26.64 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  29.53 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  28.3 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  28.48 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.27 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  29.53 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  29.05 
 
 		 361 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.58 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  26.21 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.15 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  28.44 
 
 		 390 aa  99.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  29.52 
 
 		 366 aa  99.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  30.3 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  29.05 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  27.1 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  27.59 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  29.19 
 
 		 374 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13163  permease  26.85 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  23.86 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  28.97 
 
 		 370 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  28.97 
 
 		 370 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.7 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.09 
 
 		 379 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  29.07 
 
 		 357 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  28.79 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  30.35 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2453  hypothetical protein  28.23 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  28.88 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  29.46 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  27.45 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  25.52 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.15 
 
 		 361 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  28.3 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  25.55 
 
 		 357 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  29.93 
 
 		 360 aa  93.6  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  21.63 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  26.15 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.03 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  29.05 
 
 		 366 aa  93.2  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  26.37 
 
 		 357 aa  92.8  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.23 
 
 		 345 aa  92.8  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  25.08 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.7 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.7 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.7 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  23.21 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  28.48 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.7 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.7 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  23.7 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>