More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0111 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0111  permease  100 
 
 
394 aa  782    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  44.6 
 
 
369 aa  318  9e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  39.78 
 
 
375 aa  270  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  31.96 
 
 
371 aa  226  7e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  36.34 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  36.34 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  36.07 
 
 
361 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  36.07 
 
 
361 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  35.81 
 
 
361 aa  213  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  35.81 
 
 
361 aa  213  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  36.07 
 
 
361 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  35.64 
 
 
361 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  35.18 
 
 
361 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  36.16 
 
 
348 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  32.82 
 
 
405 aa  199  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  35.89 
 
 
348 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  30.22 
 
 
402 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  30.22 
 
 
402 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  32.88 
 
 
396 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  34.17 
 
 
373 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  32.53 
 
 
390 aa  190  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  33.89 
 
 
373 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  34.63 
 
 
376 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  33.61 
 
 
373 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  33.61 
 
 
376 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  33.61 
 
 
376 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  33.61 
 
 
376 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  33.61 
 
 
373 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  33.61 
 
 
376 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  34.63 
 
 
373 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  33.73 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  31.99 
 
 
384 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  32.74 
 
 
392 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  33.7 
 
 
361 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  32.36 
 
 
361 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  32.36 
 
 
361 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.74 
 
 
393 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.48 
 
 
343 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.55 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  32.55 
 
 
354 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  30.5 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.95 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  27.92 
 
 
377 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  23.32 
 
 
398 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.03 
 
 
424 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.89 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.97 
 
 
348 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.45 
 
 
355 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.45 
 
 
355 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.45 
 
 
355 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.45 
 
 
355 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.45 
 
 
355 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.75 
 
 
417 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.3 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.3 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.48 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.17 
 
 
353 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  26.06 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.2 
 
 
435 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  29.28 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.39 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 
344 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  29.15 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 
349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.23 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  24.53 
 
 
345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.65 
 
 
379 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  25.15 
 
 
357 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  26.18 
 
 
368 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.15 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.9 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  28.11 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  25.14 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  26.79 
 
 
353 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 
353 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  26.79 
 
 
353 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.45 
 
 
355 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  26.79 
 
 
353 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  26.79 
 
 
353 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  26.79 
 
 
353 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  26.79 
 
 
353 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  26.79 
 
 
353 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  26.79 
 
 
353 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  26.63 
 
 
356 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  24.86 
 
 
366 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  26.56 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.76 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  26.01 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  27.76 
 
 
354 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  27.76 
 
 
354 aa  110  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  27.76 
 
 
354 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  28.48 
 
 
363 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  24.54 
 
 
357 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  26.74 
 
 
356 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  24.31 
 
 
372 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  24.45 
 
 
366 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  27.33 
 
 
357 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  23.56 
 
 
357 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 
353 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  25.4 
 
 
356 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>