More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0716 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  729    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  97.27 
 
 		 391 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  51.03 
 
 		 377 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  38.94 
 
 		 540 aa  229  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  36.21 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  37.68 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  33.57 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  30.66 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  30.14 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  31.66 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  30.66 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0411  protein of unknown function UPF0118  28.65 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1755  hypothetical protein  31.83 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  27.43 
 
 		 366 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  26.55 
 
 		 366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.63 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.27 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.18 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.63 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.47 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.68 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.14 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.48 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  27.03 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.75 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.96 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.07 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.07 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.96 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.96 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.96 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.96 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.96 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.96 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.9 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  26.65 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  25.71 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  25.98 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  25.98 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  26.69 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.18 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  23.93 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.52 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  24.57 
 
 		 394 aa  96.3  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  25.22 
 
 		 424 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  24.55 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.85 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  23.1 
 
 		 341 aa  92.8  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  24.65 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25.62 
 
 		 415 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  26.14 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  23.72 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  23.77 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  25.56 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 354 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  25.91 
 
 		 378 aa  89.4  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  25.95 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  25.95 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.47 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.56 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  23.23 
 
 		 365 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  30 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  23.87 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.32 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 529 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.01 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.22 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.36 
 
 		 368 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  22.7 
 
 		 374 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  23.6 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  24.55 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  26.3 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.99 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  22.46 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  26.67 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  22.46 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  24.75 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  22.08 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.62 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  22.11 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  24.27 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  26.06 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  24.28 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  24.28 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  22.44 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  22.44 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  22.44 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  22.44 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  22.44 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  22.44 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  22.44 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  22.44 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  22.44 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  22.46 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  24.28 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  22.46 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  24.28 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  24.28 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>