More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1793 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  44.79 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  47.55 
 
 		 529 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  44.87 
 
 		 443 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  45.13 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  44.62 
 
 		 413 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  42.63 
 
 		 412 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  42.77 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  41.52 
 
 		 486 aa  230  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  41.78 
 
 		 371 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  34.99 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  38.81 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  37.08 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  36.72 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  31.29 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  31.94 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  31.56 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  32.61 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  28.06 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  30.5 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  39.07 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  28.7 
 
 		 372 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.71 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.71 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  29.61 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.39 
 
 		 355 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.39 
 
 		 355 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.71 
 
 		 399 aa  103  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.39 
 
 		 355 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  26.49 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.39 
 
 		 355 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.39 
 
 		 355 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.86 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  21.94 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  26.85 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  28.86 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  26.74 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.35 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  28.06 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  24.83 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  26.19 
 
 		 362 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  26.46 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.7 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.22 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  27.43 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.75 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.07 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.38 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  24.16 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  26.98 
 
 		 455 aa  97.1  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.41 
 
 		 373 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  27.49 
 
 		 357 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.83 
 
 		 376 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 340 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  26.55 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  27.3 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  26.83 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  23.83 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  23.83 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  23.83 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  24.33 
 
 		 438 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.83 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.85 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  25.71 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.55 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  26.71 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.46 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.46 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.58 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.49 
 
 		 376 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  27.84 
 
 		 368 aa  92.8  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.08 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  27.08 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  25.71 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  26.48 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  27.33 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  26.9 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.79 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  23.28 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.12 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  22.52 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.77 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.95 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  27.19 
 
 		 357 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.92 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.92 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.92 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.59 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.76 
 
 		 348 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.92 
 
 		 348 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  25.24 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  22.26 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.92 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>