More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1463 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
407 aa  809    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0411  protein of unknown function UPF0118  37.69 
 
 
402 aa  273  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  28.94 
 
 
391 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  29.43 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  29.01 
 
 
377 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  29.71 
 
 
540 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  26.96 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  28.65 
 
 
378 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1755  hypothetical protein  28.18 
 
 
372 aa  151  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  28.82 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  28.69 
 
 
368 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  29.25 
 
 
372 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  27.86 
 
 
377 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  29.43 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  29.43 
 
 
366 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  31.14 
 
 
434 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.93 
 
 
343 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.51 
 
 
369 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  28.04 
 
 
376 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  27.18 
 
 
376 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.29 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.19 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  27.51 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  26.91 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.91 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.91 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.91 
 
 
373 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  26.65 
 
 
373 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.5 
 
 
349 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.78 
 
 
373 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  23.36 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.91 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.37 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  23.99 
 
 
435 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.37 
 
 
348 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.08 
 
 
361 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.08 
 
 
361 aa  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.08 
 
 
361 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.49 
 
 
361 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.08 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  22.49 
 
 
361 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.49 
 
 
361 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  22.57 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.94 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 
400 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.65 
 
 
417 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.95 
 
 
349 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.69 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  22.45 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  21.02 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  22.11 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  21.35 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  21.02 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  24.45 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  22.98 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  22.26 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  22.57 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21.99 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  24.7 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  23.27 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  23.5 
 
 
363 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  22.49 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  23.24 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  24.09 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  24.93 
 
 
353 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  24.63 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  23.15 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  23.37 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  24.51 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  23.92 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  23.84 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  23.91 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  20.06 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  24.5 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  21.91 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  23.84 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.12 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  22.83 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  21.15 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  25.17 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  23.56 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  22.5 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  22.5 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  23.84 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  22.5 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  22.5 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  22.74 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  23.56 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  22.5 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  20.58 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.32 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  24.47 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  23.56 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  22.39 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  23.56 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  23.56 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  23.84 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  23.56 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.62 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>