More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2392 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  675    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  49.42 
 
 
379 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  49.41 
 
 
372 aa  332  7.000000000000001e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  50.87 
 
 
344 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  50.58 
 
 
344 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  42.44 
 
 
340 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  45.09 
 
 
344 aa  272  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  43.02 
 
 
347 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  44.02 
 
 
382 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  47.65 
 
 
336 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  44.09 
 
 
345 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  43.64 
 
 
345 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  43.35 
 
 
345 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  39 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  45.3 
 
 
357 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  35.73 
 
 
359 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  35.8 
 
 
358 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  34.09 
 
 
358 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  34.68 
 
 
347 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  33.61 
 
 
360 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  34.39 
 
 
347 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  32.43 
 
 
347 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  34.65 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  33.74 
 
 
347 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  29.33 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  33.64 
 
 
356 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  29.66 
 
 
372 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  33.95 
 
 
333 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.09 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  32.69 
 
 
329 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  28.3 
 
 
350 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  26.2 
 
 
349 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  26.88 
 
 
364 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  25.38 
 
 
340 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  27.42 
 
 
376 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  24.85 
 
 
381 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  25.53 
 
 
371 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  27.24 
 
 
349 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  26.61 
 
 
400 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  25.08 
 
 
340 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  23.19 
 
 
368 aa  99.4  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 
368 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  26.67 
 
 
387 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  23.31 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  24.68 
 
 
529 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  31.68 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  27 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  28.21 
 
 
365 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 
388 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  27.74 
 
 
346 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 
354 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.11 
 
 
361 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.51 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  24.84 
 
 
383 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.11 
 
 
361 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.67 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.2 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.11 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.11 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.11 
 
 
348 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.11 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.15 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.11 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.07 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.81 
 
 
361 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.81 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.81 
 
 
348 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  26.52 
 
 
443 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  24.17 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  25.52 
 
 
436 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.32 
 
 
365 aa  86.3  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  27.05 
 
 
392 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  27.05 
 
 
401 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  24.69 
 
 
357 aa  85.9  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  28.17 
 
 
424 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  22.92 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.7 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  22.73 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  32.16 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  27.1 
 
 
435 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  25.94 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.7 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  25.24 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  26.16 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.32 
 
 
355 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  22.16 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.48 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.48 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.48 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.48 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.48 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  24.47 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  24.34 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.5 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2750  hypothetical protein  28.88 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  26.55 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.74 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.1 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>