More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2554 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  681    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  39.94 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  34.66 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  41.48 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  36 
 
 		 350 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  36.98 
 
 		 364 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  38.59 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  39.82 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  34.22 
 
 		 370 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  33.64 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  36.25 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  35.92 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  33.73 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  35.48 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  30.89 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  31.75 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  32.38 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  31.33 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  29.05 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  31.12 
 
 		 382 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  29.97 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  33.89 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  36.84 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  27.95 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  37.18 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  30.57 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  38.16 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  30.42 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  30.4 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  30.75 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  27.22 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  36.71 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  36.71 
 
 		 392 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  28.05 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  32.24 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  32.54 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  34.88 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  30.84 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  35.68 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  28.96 
 
 		 395 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  38 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  31.56 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  30.13 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  30.13 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  27.41 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  32.83 
 
 		 665 aa  102  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  28.32 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  28.32 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  28.32 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  28.32 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  28.32 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  28.32 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  28.32 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  28.32 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  28.32 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.57 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  37.5 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  28.99 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  37.77 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  31 
 
 		 652 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  31.8 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.06 
 
 		 343 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  25.07 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  27.22 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  30.57 
 
 		 652 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  27.67 
 
 		 395 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  26.85 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.97 
 
 		 351 aa  93.2  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  24.22 
 
 		 347 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  26.92 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25.67 
 
 		 404 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  29.86 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  28.82 
 
 		 649 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  27.27 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.96 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  28.3 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  25.22 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.7 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  30.04 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  24.92 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  33.05 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.61 
 
 		 373 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  32.93 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.21 
 
 		 387 aa  89.7  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  31.25 
 
 		 425 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  37.43 
 
 		 435 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  32.42 
 
 		 373 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.8 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  32.14 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  26.57 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.57 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  26.57 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.57 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.57 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  32.02 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  24.3 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>